More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00620 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  100 
 
 
1131 aa  2295    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
955 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 
1965 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 
585 aa  360  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 
697 aa  338  5e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.2 
 
 
701 aa  337  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.31 
 
 
1287 aa  332  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 
1501 aa  331  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.38 
 
 
708 aa  330  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.72 
 
 
1557 aa  327  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
696 aa  327  9e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 
1431 aa  326  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.03 
 
 
1478 aa  327  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.16 
 
 
1330 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 
1068 aa  323  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.25 
 
 
628 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
1548 aa  319  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  44.1 
 
 
1407 aa  319  2e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 
1297 aa  318  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  46.97 
 
 
725 aa  318  3e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.59 
 
 
934 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.24 
 
 
1184 aa  314  6.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  38.45 
 
 
678 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  42.48 
 
 
519 aa  310  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  45 
 
 
1399 aa  310  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.01 
 
 
865 aa  310  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  42 
 
 
1391 aa  308  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.31 
 
 
1808 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 
1177 aa  306  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.9 
 
 
1419 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.48 
 
 
1002 aa  306  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.41 
 
 
882 aa  305  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.85 
 
 
1331 aa  304  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.83 
 
 
678 aa  301  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.24 
 
 
720 aa  301  6e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 
889 aa  300  8e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.83 
 
 
631 aa  300  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
796 aa  297  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2452  histidine kinase  49.07 
 
 
459 aa  293  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137495  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
680 aa  291  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 
606 aa  290  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  40.67 
 
 
676 aa  285  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1302  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  44.12 
 
 
1220 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.772751 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 
663 aa  284  7.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  42.46 
 
 
587 aa  284  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.37 
 
 
662 aa  283  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4696  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  44.28 
 
 
1214 aa  275  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.64 
 
 
653 aa  274  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1059 aa  271  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4406  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 
653 aa  271  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02235  composite two-component sensor kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  32.21 
 
 
796 aa  266  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.66 
 
 
866 aa  266  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 
794 aa  264  8e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410783  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 
794 aa  264  8e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  29.18 
 
 
1560 aa  264  8e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.42 
 
 
1002 aa  263  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 
660 aa  261  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 
1011 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.9 
 
 
1791 aa  255  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.26 
 
 
1407 aa  251  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.3 
 
 
663 aa  250  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.45 
 
 
664 aa  250  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
1358 aa  248  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
666 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
666 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
656 aa  247  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 
689 aa  246  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 
844 aa  244  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 
844 aa  243  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 
781 aa  243  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.21 
 
 
672 aa  243  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.41 
 
 
768 aa  242  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.73 
 
 
1535 aa  241  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 
944 aa  241  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  29.22 
 
 
1125 aa  240  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 
1124 aa  238  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 
768 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 
768 aa  238  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 
768 aa  238  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 
770 aa  238  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.186908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.9 
 
 
1125 aa  237  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.1 
 
 
1371 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3030  sensory box histidine kinase/response regulator  39.55 
 
 
771 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3159  sensory box histidine kinase/response regulator  39.55 
 
 
771 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 
827 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.85 
 
 
1313 aa  235  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 
1120 aa  235  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 
1084 aa  235  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.86 
 
 
776 aa  234  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1379  sensory box histidine kinase/response regulator  39.5 
 
 
769 aa  234  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1979  sensory box histidine kinase/response regulator  39.3 
 
 
771 aa  234  9e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1289  sensory box histidine kinase/response regulator  39.3 
 
 
772 aa  234  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2264  sensory box histidine kinase/response regulator  39.3 
 
 
771 aa  234  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.87596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1000  sensory box histidine kinase/response regulator  39.3 
 
 
771 aa  234  9e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.84 
 
 
1380 aa  231  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 
1398 aa  231  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5450  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 
799 aa  231  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  36.04 
 
 
908 aa  231  8e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.09 
 
 
1287 aa  230  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.31 
 
 
654 aa  229  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>