More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4406 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4406  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
653 aa  1319    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.92 
 
 
663 aa  622  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.02 
 
 
660 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 
680 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 
889 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 
934 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.1 
 
 
1407 aa  284  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 
955 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
1478 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  37.26 
 
 
1399 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.19 
 
 
628 aa  277  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  35.58 
 
 
678 aa  277  6e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
865 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 
1501 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
1331 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 
1557 aa  274  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
1297 aa  273  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 
1808 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 
585 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
696 aa  272  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  36.85 
 
 
1131 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.72 
 
 
1419 aa  271  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 
701 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.35 
 
 
1361 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 
1287 aa  269  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  38.48 
 
 
725 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 
1002 aa  266  8.999999999999999e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 
708 aa  266  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 
697 aa  265  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
1431 aa  263  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 
606 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 
1330 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 
720 aa  259  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
781 aa  259  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.23 
 
 
1391 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
678 aa  258  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
587 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
631 aa  257  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 
662 aa  256  8e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 
1965 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 
1184 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2452  histidine kinase  41.14 
 
 
459 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137495  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
796 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 
770 aa  251  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.186908 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 
768 aa  250  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
882 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 
653 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
1068 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  37.38 
 
 
676 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 
1287 aa  244  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  28.28 
 
 
659 aa  242  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.88 
 
 
1371 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 
1548 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4696  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.27 
 
 
1214 aa  238  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  36.56 
 
 
1384 aa  237  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  36.57 
 
 
519 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.85 
 
 
1408 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 
794 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 
768 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 
794 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410783  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 
656 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 
768 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 
768 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.03 
 
 
1380 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 
776 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 
1223 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
664 aa  231  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1302  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.44 
 
 
1220 aa  231  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.772751 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
663 aa  230  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
666 aa  230  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
666 aa  230  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 
672 aa  227  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_003296  RS02235  composite two-component sensor kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  38.65 
 
 
796 aa  225  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 
776 aa  225  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5450  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.87 
 
 
799 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 
654 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3159  sensory box histidine kinase/response regulator  36.71 
 
 
771 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882119  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3030  sensory box histidine kinase/response regulator  36.71 
 
 
771 aa  221  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1379  sensory box histidine kinase/response regulator  36.9 
 
 
769 aa  220  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1289  sensory box histidine kinase/response regulator  36.71 
 
 
772 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1979  sensory box histidine kinase/response regulator  36.71 
 
 
771 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2264  sensory box histidine kinase/response regulator  36.71 
 
 
771 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.87596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1000  sensory box histidine kinase/response regulator  36.71 
 
 
771 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 
1691 aa  220  7.999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 
674 aa  214  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
755 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0992  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 
663 aa  213  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374279  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
522 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 
816 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
664 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 
657 aa  206  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 
906 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 
652 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
633 aa  204  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.42 
 
 
846 aa  204  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 
652 aa  204  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 
689 aa  203  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0667  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 
703 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.43 
 
 
1084 aa  201  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 
526 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>