More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5081 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5081  PAS  100 
 
 
659 aa  1321    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 
1287 aa  326  7e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  46.25 
 
 
547 aa  320  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
938 aa  314  3.9999999999999997e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 
835 aa  297  4e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.38 
 
 
866 aa  297  5e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
930 aa  288  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  43.24 
 
 
518 aa  283  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  43.77 
 
 
551 aa  283  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  42.57 
 
 
1344 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
776 aa  278  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 
1223 aa  277  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 
659 aa  276  8e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.45 
 
 
1261 aa  276  9e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  41.1 
 
 
1303 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
776 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 
657 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.71 
 
 
764 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 
664 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 
1406 aa  264  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 
761 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.13 
 
 
1453 aa  264  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 
761 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  32.19 
 
 
1015 aa  264  4.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 
623 aa  263  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 
844 aa  263  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 
816 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 
568 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
660 aa  261  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 
1084 aa  261  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.61 
 
 
680 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
1222 aa  259  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.41 
 
 
1233 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5975  histidine kinase  41.3 
 
 
524 aa  258  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.005421  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  39.3 
 
 
537 aa  257  6e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0756537 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
660 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 
641 aa  255  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 
1185 aa  255  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.71 
 
 
1218 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  34.28 
 
 
742 aa  253  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 
844 aa  253  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 
1088 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.28 
 
 
730 aa  252  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.05 
 
 
1242 aa  251  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 
869 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2013  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 
569 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00655857 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 
760 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.01 
 
 
633 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.03 
 
 
1152 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 
539 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1492  histidine kinase  39.95 
 
 
519 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.416072 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2942  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.34 
 
 
702 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  40.69 
 
 
755 aa  244  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4167  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 
592 aa  244  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
528 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
528 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
1331 aa  243  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3029  histidine kinase  41.53 
 
 
512 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.66 
 
 
1759 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4406  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.28 
 
 
653 aa  242  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
755 aa  241  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 
639 aa  241  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 
657 aa  239  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.62 
 
 
752 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2943  histidine kinase  42.53 
 
 
512 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.779732  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.16 
 
 
663 aa  238  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 
1279 aa  237  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 
845 aa  236  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 
529 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5630  histidine kinase  38.89 
 
 
714 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.11737 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3135  histidine kinase  40.76 
 
 
512 aa  234  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0645839  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 
1808 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.52 
 
 
1698 aa  232  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
906 aa  232  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1664  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.89 
 
 
633 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0956689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 
708 aa  231  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3028  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 
702 aa  231  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.337956  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 
526 aa  231  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1737  histidine kinase  41.62 
 
 
633 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181813  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.06 
 
 
1535 aa  230  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 
689 aa  230  7e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  33.77 
 
 
884 aa  229  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  36.9 
 
 
554 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 
776 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 
572 aa  228  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 
522 aa  228  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  39.73 
 
 
741 aa  226  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 
738 aa  226  9e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
530 aa  226  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.56 
 
 
1348 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3427  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  32.89 
 
 
2031 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0889636 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 
1391 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 
1297 aa  223  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3134  histidine kinase  41.04 
 
 
702 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22778  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 
1002 aa  220  7.999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 
530 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0241  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.91 
 
 
582 aa  212  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.67 
 
 
2468 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
1431 aa  211  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
697 aa  210  7e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>