More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1750 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
660 aa  1372    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
703 aa  347  5e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.14 
 
 
869 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.3 
 
 
866 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 
776 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.78 
 
 
776 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
930 aa  314  3.9999999999999997e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 
1084 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
1261 aa  306  9.000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 
835 aa  302  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.11 
 
 
1287 aa  301  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 
760 aa  293  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 
1223 aa  290  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.28 
 
 
1088 aa  290  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  41.41 
 
 
547 aa  289  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.7 
 
 
816 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  36.63 
 
 
742 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
730 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5975  histidine kinase  44.56 
 
 
524 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.005421  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
494 aa  282  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.66 
 
 
1218 aa  280  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 
764 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
641 aa  276  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
664 aa  273  7e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.15 
 
 
1759 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 
1631 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
1406 aa  269  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  31.41 
 
 
1015 aa  268  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.64 
 
 
761 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  40.22 
 
 
755 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 
761 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5630  histidine kinase  42.3 
 
 
714 aa  265  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.11737 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.18 
 
 
1651 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 
568 aa  264  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127973  decreased coverage  0.00024777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.21 
 
 
720 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 
633 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 
938 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 
1344 aa  260  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  39.78 
 
 
518 aa  259  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 
623 aa  259  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 
572 aa  257  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  36.84 
 
 
659 aa  257  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4167  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 
592 aa  256  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 
657 aa  256  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1737  histidine kinase  41.16 
 
 
633 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181813  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
1185 aa  255  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.33 
 
 
1453 aa  254  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1664  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.9 
 
 
633 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0956689  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  39.28 
 
 
741 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
539 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.09 
 
 
951 aa  253  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
844 aa  253  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  40.97 
 
 
551 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
844 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  28.49 
 
 
1299 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
639 aa  251  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.87 
 
 
1152 aa  250  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  35.46 
 
 
1303 aa  250  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 
752 aa  250  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 
776 aa  250  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  40.7 
 
 
537 aa  250  7e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0756537 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
738 aa  249  8e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.78 
 
 
1242 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
530 aa  249  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 
568 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
526 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  35.55 
 
 
1222 aa  248  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
1140 aa  248  4e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 
659 aa  248  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 
755 aa  247  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.19 
 
 
1698 aa  247  6e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  39.84 
 
 
554 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.24 
 
 
1233 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 
530 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 
529 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 
528 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 
528 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  40 
 
 
1086 aa  244  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.48 
 
 
1415 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 
657 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
1092 aa  242  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.85 
 
 
2468 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3427  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  33.2 
 
 
2031 aa  240  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0889636 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 
845 aa  240  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 
1279 aa  240  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0992  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 
663 aa  240  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374279  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2013  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
569 aa  239  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00655857 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  34.79 
 
 
884 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.14 
 
 
1095 aa  237  6e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 
657 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 
1153 aa  235  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  62.05 
 
 
827 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 
657 aa  234  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 
906 aa  233  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
1002 aa  234  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3122  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 
540 aa  233  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.340394  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 
1808 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  59.06 
 
 
939 aa  231  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1663  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  40.34 
 
 
1093 aa  231  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.749752  normal  0.503363 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1900  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 
1057 aa  231  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.053752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>