More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5975 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5975  histidine kinase  100 
 
 
524 aa  1038    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.005421  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1492  histidine kinase  42.61 
 
 
519 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.416072 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.53 
 
 
866 aa  333  4e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.32 
 
 
776 aa  329  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.32 
 
 
776 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3135  histidine kinase  41.9 
 
 
512 aa  326  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0645839  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  41.81 
 
 
518 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2943  histidine kinase  41.11 
 
 
512 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.779732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3029  histidine kinase  41.85 
 
 
512 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  49.08 
 
 
547 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  43.55 
 
 
938 aa  317  4e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.15 
 
 
1223 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  47.25 
 
 
755 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.56 
 
 
660 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.19 
 
 
1261 aa  304  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.12 
 
 
1287 aa  303  7.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.56 
 
 
930 aa  298  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.63 
 
 
844 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.83 
 
 
844 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  42.04 
 
 
1015 aa  289  9e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.24 
 
 
869 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.76 
 
 
816 aa  287  4e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  43.32 
 
 
1303 aa  286  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  42.37 
 
 
1344 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  42.34 
 
 
659 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.06 
 
 
764 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.83 
 
 
1088 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  41.05 
 
 
1152 aa  278  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  42.86 
 
 
1218 aa  277  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.7 
 
 
760 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.15 
 
 
664 aa  277  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1084 aa  276  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5630  histidine kinase  44.27 
 
 
714 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.11737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.21 
 
 
755 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.42 
 
 
657 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.55 
 
 
761 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.11 
 
 
633 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  45.31 
 
 
742 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.62 
 
 
730 aa  269  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  46.7 
 
 
551 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  45.6 
 
 
1698 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4167  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.55 
 
 
592 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  41.69 
 
 
1222 aa  267  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1737  histidine kinase  46.92 
 
 
633 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181813  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.13 
 
 
835 aa  266  5e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.41 
 
 
761 aa  266  8e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.22 
 
 
752 aa  266  8e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  45.91 
 
 
1233 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1664  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.92 
 
 
633 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0956689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.97 
 
 
1185 aa  263  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  42.86 
 
 
554 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.67 
 
 
522 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.87 
 
 
639 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 
568 aa  257  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.4 
 
 
738 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.89 
 
 
1242 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  45.63 
 
 
741 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  43.15 
 
 
537 aa  253  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0756537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  42.2 
 
 
1535 aa  252  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  42.47 
 
 
1759 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.17 
 
 
641 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 
1406 aa  250  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1103  histidine kinase  35.17 
 
 
531 aa  250  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.458922  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2942  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.68 
 
 
702 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897088  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  39.55 
 
 
572 aa  250  5e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.37 
 
 
657 aa  250  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2013  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 
569 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00655857 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3028  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.87 
 
 
702 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.337956  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  42.34 
 
 
2468 aa  243  9e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 
1331 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
955 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.15 
 
 
1431 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
529 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 
539 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.29 
 
 
623 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 
1297 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 
776 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 
659 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.08 
 
 
526 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
906 aa  236  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 
1478 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
1279 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.59 
 
 
1965 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0241  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.62 
 
 
582 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.57 
 
 
1453 aa  234  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 
934 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.48 
 
 
1380 aa  231  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.11 
 
 
1184 aa  230  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  34.65 
 
 
884 aa  230  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3134  histidine kinase  45.36 
 
 
702 aa  230  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22778  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 
845 aa  229  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 
882 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5775  histidine kinase  38.59 
 
 
554 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.941039 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0027  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 
917 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3122  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.44 
 
 
540 aa  227  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.340394  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1900  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1057 aa  226  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.053752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
889 aa  226  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
528 aa  226  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.22 
 
 
1068 aa  226  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
528 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>