More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0397 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
755 aa  1529    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.55 
 
 
738 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  38.87 
 
 
741 aa  386  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  37.64 
 
 
755 aa  364  3e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.69 
 
 
752 aa  361  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.22 
 
 
776 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.11 
 
 
776 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.61 
 
 
816 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.67 
 
 
1261 aa  295  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.65 
 
 
664 aa  286  8e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  44.47 
 
 
1698 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  44.97 
 
 
1759 aa  284  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.87 
 
 
866 aa  283  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  44.17 
 
 
1453 aa  277  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.3 
 
 
844 aa  277  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  42.14 
 
 
1242 aa  277  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  42.78 
 
 
547 aa  277  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1900  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.32 
 
 
1057 aa  277  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.053752 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1492  histidine kinase  43.5 
 
 
519 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.416072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.34 
 
 
844 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.33 
 
 
764 aa  273  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3029  histidine kinase  46.04 
 
 
512 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40.93 
 
 
1152 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 
869 aa  270  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.24 
 
 
623 aa  270  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 
568 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3135  histidine kinase  45.64 
 
 
512 aa  268  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0645839  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  46.67 
 
 
537 aa  267  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0756537 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2943  histidine kinase  45.43 
 
 
512 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.779732  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  41.9 
 
 
1303 aa  266  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.78 
 
 
1478 aa  264  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
934 aa  264  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 
955 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 
1084 aa  260  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.73 
 
 
760 aa  260  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.28 
 
 
522 aa  260  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 
1965 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.82 
 
 
730 aa  258  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.88 
 
 
1233 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  42.57 
 
 
742 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 
1279 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.38 
 
 
659 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  40.66 
 
 
1344 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5975  histidine kinase  45.21 
 
 
524 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.005421  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 
660 aa  253  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  37.06 
 
 
1222 aa  253  8.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 
1223 aa  252  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.78 
 
 
906 aa  251  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 
697 aa  251  5e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.05 
 
 
641 aa  250  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  41.6 
 
 
518 aa  250  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 
889 aa  249  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
938 aa  249  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.67 
 
 
1348 aa  248  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 
1431 aa  248  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  44.29 
 
 
2468 aa  247  6e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4167  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 
592 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.85 
 
 
1501 aa  247  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  44.92 
 
 
551 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
1419 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2013  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 
569 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00655857 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  38.73 
 
 
659 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.44 
 
 
1088 aa  245  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3427  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  41.27 
 
 
2031 aa  243  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0889636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1287 aa  243  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 
657 aa  243  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 
1330 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 
696 aa  242  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  37.73 
 
 
554 aa  242  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 
708 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 
1808 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  39.44 
 
 
725 aa  241  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.23 
 
 
1185 aa  241  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 
930 aa  241  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 
865 aa  240  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
628 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 
1184 aa  239  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  36.45 
 
 
1015 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 
1391 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.02 
 
 
761 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.11 
 
 
835 aa  238  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.04 
 
 
1218 aa  237  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 
761 aa  236  9e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 
1297 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 
882 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 
633 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.89 
 
 
1535 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5630  histidine kinase  42.41 
 
 
714 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.11737 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
701 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0667  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
703 aa  233  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 
1557 aa  232  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 
1331 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  37.74 
 
 
1384 aa  231  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.13 
 
 
1548 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 
653 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 
1068 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 
1002 aa  231  5e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5171  histidine kinase  37.74 
 
 
584 aa  230  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.944283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 
680 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
720 aa  229  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>