More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4990 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
955 aa  1962    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 
1501 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 
865 aa  490  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.37 
 
 
1478 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.4 
 
 
1391 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.12 
 
 
1002 aa  487  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 
934 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 
1965 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  57.14 
 
 
708 aa  460  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.42 
 
 
1297 aa  459  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.9 
 
 
889 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.25 
 
 
1068 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 
1184 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  60 
 
 
1431 aa  445  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.28 
 
 
720 aa  438  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.31 
 
 
1557 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.11 
 
 
1808 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  34.55 
 
 
1131 aa  437  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.58 
 
 
1419 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.02 
 
 
882 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  52.9 
 
 
1399 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.78 
 
 
796 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 
628 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.11 
 
 
1330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  49.76 
 
 
1407 aa  395  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.44 
 
 
680 aa  392  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.92 
 
 
1548 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.79 
 
 
1287 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.4 
 
 
701 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.3 
 
 
1331 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.03 
 
 
653 aa  376  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  48.87 
 
 
519 aa  361  4e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.86 
 
 
697 aa  360  9.999999999999999e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.4 
 
 
696 aa  357  5e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2452  histidine kinase  49.6 
 
 
459 aa  348  4e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137495  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 
745 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  46.1 
 
 
725 aa  343  7e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.84 
 
 
606 aa  340  7e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
896 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 
689 aa  335  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  40.33 
 
 
678 aa  333  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  42.79 
 
 
587 aa  332  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  45.41 
 
 
585 aa  330  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 
794 aa  327  9e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410783  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 
794 aa  327  9e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 
1177 aa  325  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 
1255 aa  325  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.71 
 
 
869 aa  317  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
660 aa  317  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 
1075 aa  315  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
662 aa  314  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
933 aa  313  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.17 
 
 
631 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.17 
 
 
678 aa  309  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02235  composite two-component sensor kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  32.9 
 
 
796 aa  308  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1005  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
646 aa  303  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442988  decreased coverage  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 
663 aa  295  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1302  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  44.01 
 
 
1220 aa  292  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.772751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 
657 aa  292  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.85 
 
 
1363 aa  291  5.0000000000000004e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  44.25 
 
 
676 aa  290  9e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 
657 aa  289  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.88 
 
 
1380 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0779  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 
754 aa  287  5.999999999999999e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4696  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.93 
 
 
1214 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4406  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 
653 aa  283  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.68 
 
 
1535 aa  282  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 
1559 aa  283  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 
652 aa  281  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 
778 aa  277  6e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 
947 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 
652 aa  274  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.87 
 
 
1453 aa  272  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 
862 aa  272  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 
940 aa  268  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.48 
 
 
1002 aa  267  8.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
957 aa  266  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  31.5 
 
 
982 aa  264  8e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
882 aa  263  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 
666 aa  263  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 
666 aa  263  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2895  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.18 
 
 
1324 aa  261  6e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000343468  normal  0.0609683 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2941  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.71 
 
 
696 aa  261  6e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.843677  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 
656 aa  260  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  31.21 
 
 
823 aa  259  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.09 
 
 
1371 aa  260  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.51 
 
 
1408 aa  259  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 
1085 aa  259  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.54 
 
 
1125 aa  258  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 
1313 aa  258  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  28.66 
 
 
1125 aa  258  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
969 aa  258  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
1007 aa  257  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3159  sensory box histidine kinase/response regulator  28.68 
 
 
771 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882119  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0992  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 
663 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374279  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  26.62 
 
 
1258 aa  256  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3030  sensory box histidine kinase/response regulator  28.68 
 
 
771 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.21 
 
 
755 aa  256  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 
906 aa  256  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2933  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 
806 aa  255  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.907124  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>