More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1703 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.01 
 
 
1274 aa  769    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  40.53 
 
 
1167 aa  703    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  40.65 
 
 
1160 aa  706    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  52.01 
 
 
1384 aa  1341    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  45.16 
 
 
1535 aa  774    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2183  hypothetical protein  39.43 
 
 
980 aa  654    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.850093 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  51.16 
 
 
1361 aa  1342    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  36.67 
 
 
1399 aa  828    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.65 
 
 
993 aa  644    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  100 
 
 
1408 aa  2890    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  43.19 
 
 
1218 aa  717    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0327  putative PAS/PAC sensor protein  39.63 
 
 
1008 aa  670    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  48.72 
 
 
1380 aa  1215    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2355  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  40.62 
 
 
1008 aa  662    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.89 
 
 
1348 aa  741    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  33.81 
 
 
1303 aa  668    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.2 
 
 
1407 aa  769    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 
1344 aa  699    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5176  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  46.26 
 
 
1404 aa  850    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.190634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  48.13 
 
 
1371 aa  1254    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2162  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB  38.98 
 
 
879 aa  628  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  40.05 
 
 
1222 aa  627  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0780  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  39.63 
 
 
887 aa  628  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1600  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.79 
 
 
1000 aa  629  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  38.27 
 
 
998 aa  627  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2045  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  40.14 
 
 
868 aa  626  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.47 
 
 
1215 aa  624  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.92 
 
 
1190 aa  625  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2460  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  38.15 
 
 
971 aa  611  1e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2549  fused CheR-type MCP methyltransferase and PAS sensor protein  36.93 
 
 
1006 aa  609  9.999999999999999e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0229  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  39.1 
 
 
1138 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  40.68 
 
 
1027 aa  602  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0563  putative PAS/PAC sensor protein  37.28 
 
 
1035 aa  597  1e-169  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 
1279 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4605  MCP methyltransferase, CheR-type  38.57 
 
 
1092 aa  581  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315944  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  41.07 
 
 
1242 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.42 
 
 
1233 aa  579  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3013  MCP methyltransferase, CheR-type  38.09 
 
 
877 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404945  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3128  MCP methyltransferase, CheR-type  37.44 
 
 
840 aa  562  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1840  MCP methyltransferase, CheR-type  37.97 
 
 
840 aa  559  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.603716 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3739  MCP methyltransferase, CheR-type  38.44 
 
 
1045 aa  559  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1118  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  36.83 
 
 
852 aa  556  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.742809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1297  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.98 
 
 
1168 aa  554  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3169  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.1 
 
 
1445 aa  552  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12648  Signal Transduction Histidine Kinase (STHK) with CheB and CheRactivity  31.08 
 
 
1200 aa  550  1e-154  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1410  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.15 
 
 
1120 aa  544  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132886  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.68 
 
 
1324 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1716  MCP methyltransferase, CheR-type  37.44 
 
 
856 aa  538  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.92135  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  36.52 
 
 
1483 aa  531  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3046  hypothetical protein  37.35 
 
 
1010 aa  531  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164382 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.5 
 
 
1163 aa  529  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  38.5 
 
 
1061 aa  521  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3165  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.25 
 
 
1306 aa  523  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0310  MCP methyltransferase, CheR-type  34.57 
 
 
1149 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.512157  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3913  PAS sensor protein  34.19 
 
 
1337 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.290527  normal  0.28306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.28 
 
 
1759 aa  513  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.22 
 
 
1698 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.35 
 
 
2468 aa  501  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.12 
 
 
1499 aa  503  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  36.86 
 
 
1063 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0399  MCP methyltransferase, CheR-type  33.06 
 
 
820 aa  496  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.1 
 
 
1453 aa  480  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2229  methylesterase CheB/methylase CheR  35.08 
 
 
1170 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840236  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4430  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.86 
 
 
1158 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0905  putative PAS/PAC sensor protein  35.08 
 
 
1170 aa  466  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.968727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  30.45 
 
 
1193 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2264  putative PAS/PAC sensor protein  35.1 
 
 
1165 aa  456  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.620072  normal  0.0600346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5709  MCP methyltransferase, CheR-type  35.76 
 
 
853 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.729466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3102  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.77 
 
 
1418 aa  446  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1237  chemotaxis response regulator (methyltransferase)  32.52 
 
 
1618 aa  446  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1246  methyltransferase CheR, putative  35.95 
 
 
1378 aa  431  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271052  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1028  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.19 
 
 
1248 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.507304 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.19 
 
 
1535 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4696  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.86 
 
 
1214 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1302  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.4 
 
 
1220 aa  417  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.772751 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0460  MCP methyltransferase, CheR-type  33.11 
 
 
837 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.604812  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2227  MCP methyltransferase, CheR-type  33 
 
 
824 aa  392  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2564  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.31 
 
 
1089 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0370  protein-glutamate O-methyltransferase  37.62 
 
 
639 aa  386  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.181962  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6341  putative PAS/PAC sensor protein  41.2 
 
 
629 aa  382  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433344  normal  0.230755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3390  MCP methyltransferase, CheR-type  37.64 
 
 
617 aa  369  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2975  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.13 
 
 
1084 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3990  MCP methyltransferase, CheR-type  42.62 
 
 
432 aa  337  7e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5191  CheB methylesterase:MCP methyltransferase, CheR-type  29.72 
 
 
813 aa  335  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5175  MCP methyltransferase, CheR-type  29.12 
 
 
823 aa  333  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.367936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1989  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  34.9 
 
 
1110 aa  328  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175442  normal  0.013335 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 
657 aa  296  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 
1501 aa  292  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
1084 aa  292  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3640  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  32.17 
 
 
1303 aa  283  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.581797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 
1391 aa  280  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 
639 aa  280  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03023  methyltransferase  34.29 
 
 
604 aa  279  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.361036  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 
657 aa  278  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 
652 aa  275  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
641 aa  274  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
652 aa  271  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 
1331 aa  270  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 
526 aa  269  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 
865 aa  268  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>