More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4112 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
639 aa  1308    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.31 
 
 
657 aa  620  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.26 
 
 
657 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.67 
 
 
641 aa  537  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.51 
 
 
528 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.51 
 
 
528 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.5 
 
 
539 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.27 
 
 
526 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.27 
 
 
776 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.67 
 
 
529 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 
845 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.29 
 
 
530 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.89 
 
 
530 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 
643 aa  361  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
662 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.09 
 
 
651 aa  356  6.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 
642 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 
642 aa  347  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750197  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  36.18 
 
 
678 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 
660 aa  333  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.66 
 
 
810 aa  327  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
1084 aa  318  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 
653 aa  316  8e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.28 
 
 
1535 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2691  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
639 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3591  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 
650 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.59 
 
 
1371 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 
807 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5407  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 
815 aa  308  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
781 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 
652 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
776 aa  296  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 
782 aa  296  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
789 aa  296  9e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
789 aa  296  9e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 
1344 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 
652 aa  294  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 
776 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2015  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
538 aa  286  9e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
938 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3125  putative sensor/response regulator hybrid  33.54 
 
 
650 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 
630 aa  283  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  34.78 
 
 
1303 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.65 
 
 
1408 aa  280  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
835 aa  278  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36420  putative sensor/response regulator hybrid  33.23 
 
 
699 aa  277  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426849  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  32.57 
 
 
1384 aa  276  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
789 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.08 
 
 
1361 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.82 
 
 
1287 aa  269  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.58 
 
 
869 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
906 aa  266  5.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  41.86 
 
 
518 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
784 aa  264  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
1223 aa  261  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  32.56 
 
 
746 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  39.47 
 
 
547 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.05 
 
 
1380 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.33 
 
 
1348 aa  259  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 
866 aa  259  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  40.5 
 
 
755 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 
761 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 
761 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.53 
 
 
930 aa  254  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 
1261 aa  253  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05296  Two-component system protein A (EC 2.7.13.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P896]  32.5 
 
 
682 aa  253  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  32.51 
 
 
779 aa  253  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
1406 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 
816 aa  251  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 
660 aa  251  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 
1088 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1658  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  43.36 
 
 
693 aa  246  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000881395  normal  0.485091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2374  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  43.36 
 
 
693 aa  246  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.79 
 
 
1218 aa  245  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2470  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.4 
 
 
693 aa  244  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000343207  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 
493 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  38.34 
 
 
659 aa  241  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 
764 aa  240  5e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.81 
 
 
752 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  33.25 
 
 
884 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5630  histidine kinase  41.88 
 
 
714 aa  237  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.11737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 
844 aa  238  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 
844 aa  237  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5171  histidine kinase  38.36 
 
 
584 aa  236  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.944283 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 
760 aa  236  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
664 aa  236  9e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  41.08 
 
 
741 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0241  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.36 
 
 
582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  37.12 
 
 
742 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.05 
 
 
1698 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
1185 aa  235  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
730 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
738 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  37.17 
 
 
554 aa  234  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 
1501 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 
568 aa  233  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  30.03 
 
 
812 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.57 
 
 
1242 aa  230  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 
743 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 
680 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>