More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1939 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  89.73 
 
 		 746 aa  1327    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  100 
 
 		 779 aa  1563    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  46.29 
 
 		 784 aa  643    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4184  multi-sensor hybrid histidine kinase  60.62 
 
 		 783 aa  832    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 		 1007 aa  312  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2390  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 		 618 aa  300  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.868312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 		 657 aa  298  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2093  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 		 530 aa  290  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.874358  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 		 869 aa  290  9e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2100  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.39 
 
 		 637 aa  288  4e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.269626 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6413  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  44.56 
 
 		 404 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.341429  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 697 aa  283  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  35.69 
 
 		 935 aa  278  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 539 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3167  signal transduction histidine kinase-like protein  36.59 
 
 		 1077 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540842 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.97 
 
 		 948 aa  271  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.19 
 
 		 878 aa  270  7e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1124  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 		 502 aa  270  8.999999999999999e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.963767  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 		 602 aa  267  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 		 657 aa  264  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 		 641 aa  262  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3690  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.46 
 
 		 833 aa  260  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0862317  normal  0.782884 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 		 901 aa  260  8e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 		 529 aa  259  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 		 526 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 		 776 aa  257  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  36.47 
 
 		 938 aa  256  8e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 		 528 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 530 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 528 aa  253  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 639 aa  253  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1409  Signal transduction histidine kinase-like  36.09 
 
 		 685 aa  251  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 530 aa  251  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 989 aa  245  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1643  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 		 633 aa  237  7e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.231435  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05296  Two-component system protein A (EC 2.7.13.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P896]  31.12 
 
 		 682 aa  235  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2494  signal transduction histidine kinase-like protein  34.42 
 
 		 1317 aa  234  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1035  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 		 1041 aa  234  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 657 aa  233  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 791 aa  231  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.52 
 
 		 1535 aa  230  9e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4197  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 679 aa  230  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  31.87 
 
 		 823 aa  229  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2066  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 		 1167 aa  229  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.082343  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 989 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 		 674 aa  227  8e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  31.39 
 
 		 943 aa  226  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  30.81 
 
 		 764 aa  225  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 		 1222 aa  223  9e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 1046 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 		 845 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 1116 aa  222  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 		 927 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.14 
 
 		 1380 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 662 aa  220  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 780 aa  218  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 		 882 aa  218  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1189  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.12 
 
 		 971 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 970 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 947 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 643 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 		 1323 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 		 1090 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 881 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 		 770 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 		 1090 aa  214  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3381  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 		 902 aa  213  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.247292 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 870 aa  213  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1934  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 		 1015 aa  212  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452261  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 1374 aa  211  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 		 652 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1371  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 516 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  32.37 
 
 		 882 aa  211  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 		 1009 aa  210  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 		 1226 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 		 922 aa  210  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 1145 aa  209  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  29.62 
 
 		 1023 aa  209  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.46 
 
 		 1313 aa  209  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1046  histidine kinase  34.2 
 
 		 489 aa  208  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00874969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 977 aa  207  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  31.31 
 
 		 1323 aa  207  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  34.88 
 
 		 910 aa  207  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 		 1274 aa  207  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 383 aa  207  8e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143908  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  35.92 
 
 		 900 aa  206  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 		 756 aa  207  9e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  28.93 
 
 		 1384 aa  206  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.13 
 
 		 1408 aa  206  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 1146 aa  206  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1352 aa  206  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 		 652 aa  206  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0962  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.13 
 
 		 823 aa  205  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.51 
 
 		 1371 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 		 570 aa  204  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  35.61 
 
 		 1121 aa  204  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000536  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  31.74 
 
 		 858 aa  204  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 		 1326 aa  204  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 		 747 aa  204  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.94 
 
 		 1361 aa  204  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>