More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4135 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  48.87 
 
 
935 aa  810    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
922 aa  1883    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.11 
 
 
945 aa  716    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  50.74 
 
 
811 aa  474  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  45.64 
 
 
937 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  45.56 
 
 
2051 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.28 
 
 
750 aa  413  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  46.76 
 
 
781 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.76 
 
 
784 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  47.34 
 
 
902 aa  362  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.16 
 
 
865 aa  360  6e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.1 
 
 
939 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  47.07 
 
 
902 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 
720 aa  336  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 
770 aa  331  5.0000000000000004e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.9 
 
 
929 aa  327  7e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
1323 aa  325  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1758  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  43.6 
 
 
583 aa  318  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
989 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  36.76 
 
 
1323 aa  315  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.55 
 
 
1058 aa  313  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  41.41 
 
 
744 aa  309  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
989 aa  307  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 
721 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 
1090 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 
1090 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.92 
 
 
1068 aa  305  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.29 
 
 
1285 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
1146 aa  301  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.19 
 
 
1131 aa  301  5e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  37.57 
 
 
1124 aa  301  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 
1322 aa  300  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  36.04 
 
 
1257 aa  298  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 
1002 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 
1002 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 
1130 aa  295  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  40.2 
 
 
757 aa  293  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1082  histidine kinase  35.7 
 
 
1220 aa  292  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 
1187 aa  290  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 
1178 aa  288  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 
1202 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.63 
 
 
1611 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  39.32 
 
 
1028 aa  286  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1002 aa  284  5.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.63 
 
 
1578 aa  284  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  34.91 
 
 
1560 aa  283  7.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  37.95 
 
 
810 aa  283  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
1122 aa  283  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 
1099 aa  281  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
1122 aa  280  9e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
873 aa  279  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 
1127 aa  279  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  36.36 
 
 
1161 aa  278  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  36.01 
 
 
1122 aa  278  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  38.64 
 
 
800 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  37.42 
 
 
1121 aa  275  4.0000000000000004e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
1126 aa  273  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 
1154 aa  273  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 
841 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 
860 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
633 aa  271  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
1128 aa  271  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  35.26 
 
 
1128 aa  271  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 
1127 aa  270  7e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 
1195 aa  270  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 
1197 aa  269  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  36.09 
 
 
659 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  36.56 
 
 
787 aa  267  8e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  32.31 
 
 
1125 aa  265  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.18 
 
 
777 aa  265  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
631 aa  264  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  34.87 
 
 
1153 aa  264  6e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 
970 aa  264  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 
1407 aa  263  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.81 
 
 
655 aa  263  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  39.53 
 
 
735 aa  262  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3731  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1140 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1140 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0670  sensor histidine kinase/response regulator  33.52 
 
 
1170 aa  260  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.315036  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3146  histidine kinase  33.4 
 
 
1140 aa  260  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.353593  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  34.17 
 
 
1140 aa  260  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 
1197 aa  260  8e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  36.82 
 
 
794 aa  259  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 
865 aa  258  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 
1113 aa  258  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2451  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.62 
 
 
846 aa  257  8e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414748 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 
781 aa  257  8e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 
982 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4239  histidine kinase  32.69 
 
 
1211 aa  254  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  32.34 
 
 
1071 aa  254  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0978  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 
1175 aa  254  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  37.93 
 
 
823 aa  253  9.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 
1110 aa  253  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 
674 aa  253  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  36.56 
 
 
1023 aa  252  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3691  histidine kinase  31.94 
 
 
1071 aa  251  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.54 
 
 
1064 aa  251  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 
844 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 
844 aa  252  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
1173 aa  251  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>