More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1758 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1758  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  100 
 
 		 583 aa  1204    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  46.08 
 
 		 902 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  46.32 
 
 		 902 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  45.52 
 
 		 757 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.6 
 
 		 922 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  39.81 
 
 		 744 aa  304  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  38.43 
 
 		 735 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 935 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 945 aa  257  5e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1855  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  29.35 
 
 		 872 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.311227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  29.35 
 
 		 872 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0638  diguanylate cyclase  34.54 
 
 		 737 aa  230  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  34.24 
 
 		 717 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.446547  normal  0.266824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2806  sensor protein  31.32 
 
 		 633 aa  225  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682487  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5806  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 664 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1893  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  30.43 
 
 		 865 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64169e-22 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  32.92 
 
 		 643 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2402  sensor protein  31.64 
 
 		 619 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532539  hitchhiker  0.0000375596 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.16 
 
 		 678 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  52.05 
 
 		 734 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.84548  normal  0.140102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4764  Serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  30.34 
 
 		 746 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1516  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  50 
 
 		 352 aa  181  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0065858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1030  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  54.17 
 
 		 330 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3673  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  56.73 
 
 		 1262 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2222  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  53.8 
 
 		 732 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.513474  normal  0.0596169 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  31.96 
 
 		 781 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1713  diguanylate cyclase  52.98 
 
 		 462 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0807  diguanylate cyclase  53.45 
 
 		 340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2160  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  53.22 
 
 		 732 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1738  diguanylate cyclase  52.98 
 
 		 462 aa  174  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5086  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  50.89 
 
 		 465 aa  173  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0984  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  50 
 
 		 353 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.194443 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3878  sensor protein  35.04 
 
 		 782 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00432264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1805  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  51.79 
 
 		 960 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3819  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.71 
 
 		 660 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5483  CHASE2 domain protein  34.16 
 
 		 696 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0712134 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5066  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  48.54 
 
 		 338 aa  166  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3770  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.71 
 
 		 660 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  50.88 
 
 		 337 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2062  diguanylate cyclase  48.19 
 
 		 620 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.502085 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5644  putative Chase2 sensor protein  32.08 
 
 		 686 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0408867 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004464  sensory box/GGDEF family protein  48.81 
 
 		 582 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.845527  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1431  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  47.26 
 
 		 625 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  49.41 
 
 		 547 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2052  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.78 
 
 		 481 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1457  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  46.77 
 
 		 624 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00930  hypothetical protein  47.98 
 
 		 581 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2076  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.78 
 
 		 481 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00773841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  50.6 
 
 		 664 aa  160  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3770  PAS:GGDEF  44.86 
 
 		 328 aa  160  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0223226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  29.6 
 
 		 787 aa  160  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  45.61 
 
 		 1034 aa  160  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4619  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  30.12 
 
 		 841 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0311461 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1645  hypothetical protein  43.6 
 
 		 344 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  47.25 
 
 		 648 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  45.51 
 
 		 1636 aa  158  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3528  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.09 
 
 		 310 aa  158  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2812  diguanylate cyclase  48.82 
 
 		 315 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1597  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.24 
 
 		 313 aa  156  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4132  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.4 
 
 		 310 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4149  diguanylate cyclase  48.81 
 
 		 591 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0015025  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4046  diguanylate cyclase  50.6 
 
 		 370 aa  156  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.170449 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0218  diguanylate cyclase  48.77 
 
 		 304 aa  156  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0709  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.83 
 
 		 322 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.169559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3170  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.62 
 
 		 344 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.103544 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1949  sensory box/GGDEF family protein  47.02 
 
 		 579 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.773832  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4204  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.4 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1684  GGDEF domain-containing protein  45.45 
 
 		 323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4336  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  48.81 
 
 		 310 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4297  diguanylate cyclase  47.95 
 
 		 522 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  44.51 
 
 		 902 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0133  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.64 
 
 		 461 aa  154  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4407  GGDEF family protein  45.56 
 
 		 344 aa  153  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0365  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.47 
 
 		 308 aa  153  8e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2357  diguanylate cyclase  46.67 
 
 		 252 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1471  diguanylate cyclase  44.38 
 
 		 339 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.435801  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5111  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.5 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0095  putative sensory transduction system, regulatory protein  47.67 
 
 		 536 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.348008  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2534  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.25 
 
 		 421 aa  153  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.657544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1561  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.08 
 
 		 455 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734361  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1622  response regulator receiver protein  43.45 
 
 		 641 aa  152  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.923164  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4321  diguanylate cyclase  46.51 
 
 		 534 aa  151  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2499  GGDEF domain-containing protein  45.71 
 
 		 367 aa  150  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2495  diguanylate cyclase  41.52 
 
 		 422 aa  150  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4124  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.15 
 
 		 334 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.113929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.83 
 
 		 303 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4231  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.55 
 
 		 357 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113145  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0799  diguanylate cyclase  43.86 
 
 		 538 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0186826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0414  diguanylate cyclase  44.38 
 
 		 346 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3787  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.19 
 
 		 344 aa  148  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.919533  normal  0.90313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3123  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.65 
 
 		 312 aa  148  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2018  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.64 
 
 		 355 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414914  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16500  two-component response regulator  47.34 
 
 		 347 aa  147  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.67066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2939  GGDEF  44.51 
 
 		 318 aa  147  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.417006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1099  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.83 
 
 		 334 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  42.51 
 
 		 1629 aa  147  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.17 
 
 		 314 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.96 
 
 		 355 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0362  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.45 
 
 		 890 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190279  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1121  diguanylate cyclase  40.91 
 
 		 305 aa  147  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.323017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>