More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3135 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2344  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  60.17 
 
 		 850 aa  967    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1187 aa  2392    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2346  histidine kinase  62.7 
 
 		 372 aa  479  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 		 922 aa  327  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  39.61 
 
 		 2051 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.58 
 
 		 939 aa  325  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.8 
 
 		 720 aa  318  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  43.44 
 
 		 1257 aa  317  6e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 		 784 aa  311  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 811 aa  311  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  40.62 
 
 		 781 aa  311  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.79 
 
 		 721 aa  311  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 		 935 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 		 1323 aa  299  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 		 937 aa  300  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 989 aa  299  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 750 aa  298  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 989 aa  298  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  41.29 
 
 		 810 aa  297  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 		 929 aa  296  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 		 770 aa  295  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  37.42 
 
 		 1161 aa  295  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  33.28 
 
 		 1323 aa  294  8e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  41.89 
 
 		 1153 aa  292  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 		 945 aa  290  8e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 865 aa  288  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 		 1202 aa  273  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 1611 aa  273  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 		 841 aa  271  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 		 844 aa  271  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 		 844 aa  270  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  40.5 
 
 		 800 aa  270  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.25 
 
 		 1127 aa  269  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 		 1578 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  38.82 
 
 		 1124 aa  266  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 		 1068 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 		 1322 aa  263  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  34.06 
 
 		 1121 aa  263  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 		 1285 aa  261  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  32.37 
 
 		 794 aa  260  8e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.05 
 
 		 1058 aa  260  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 		 1178 aa  260  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 		 1130 aa  258  6e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 		 1197 aa  257  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 		 1146 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 		 1090 aa  254  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 		 1090 aa  254  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 		 1122 aa  254  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 		 780 aa  254  9.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 		 747 aa  252  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  33.39 
 
 		 1028 aa  253  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 		 762 aa  253  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.91 
 
 		 1124 aa  252  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  38.16 
 
 		 853 aa  252  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 1127 aa  251  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 		 1099 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  35.79 
 
 		 1023 aa  251  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 		 803 aa  251  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  32.39 
 
 		 787 aa  251  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.34 
 
 		 874 aa  251  8e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3146  histidine kinase  38.21 
 
 		 1140 aa  250  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.353593  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.54 
 
 		 1002 aa  250  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.54 
 
 		 1002 aa  250  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 901 aa  250  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 1122 aa  250  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  37.56 
 
 		 777 aa  249  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4239  histidine kinase  37.02 
 
 		 1211 aa  249  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  35.43 
 
 		 1122 aa  249  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.04 
 
 		 1350 aa  248  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 1407 aa  248  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0978  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.2 
 
 		 1175 aa  248  6.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 645 aa  247  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 		 1197 aa  247  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 		 916 aa  247  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 		 633 aa  246  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  36.05 
 
 		 1125 aa  246  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 		 995 aa  245  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 773 aa  245  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 1110 aa  244  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 		 1193 aa  244  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 		 1193 aa  244  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3731  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 1140 aa  244  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 1140 aa  244  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 1433 aa  244  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 1002 aa  244  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.29 
 
 		 1195 aa  243  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0670  sensor histidine kinase/response regulator  37.83 
 
 		 1170 aa  243  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.315036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  36.13 
 
 		 1140 aa  243  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 		 982 aa  243  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 		 1284 aa  242  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 1070 aa  242  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 870 aa  241  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  36.12 
 
 		 1128 aa  241  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2976  two-component hybrid sensor and regulator  31.73 
 
 		 1132 aa  241  5e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.210238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 		 759 aa  241  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  38.81 
 
 		 606 aa  241  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 		 896 aa  241  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 		 1128 aa  241  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3167  signal transduction histidine kinase-like protein  32.95 
 
 		 1077 aa  239  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540842 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.99 
 
 		 738 aa  239  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>