More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2148 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
937 aa  1925    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  33.87 
 
 
1119 aa  471  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.64 
 
 
922 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  33.67 
 
 
1207 aa  443  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  33.53 
 
 
1133 aa  435  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  32.53 
 
 
1130 aa  425  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  44.72 
 
 
811 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  44.03 
 
 
781 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.87 
 
 
935 aa  399  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  40.57 
 
 
2051 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.37 
 
 
750 aa  392  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.01 
 
 
945 aa  389  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 
674 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 
912 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.12 
 
 
939 aa  372  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  43.82 
 
 
967 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  43.82 
 
 
967 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.37 
 
 
784 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 
770 aa  365  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 
1323 aa  362  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.92 
 
 
865 aa  357  5.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2807  putative PAS/PAC sensor protein  37.74 
 
 
730 aa  346  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.135813 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 
721 aa  343  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  38.42 
 
 
1323 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.42 
 
 
989 aa  332  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  42.38 
 
 
790 aa  327  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 
989 aa  325  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 
720 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
929 aa  311  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 
1058 aa  307  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  38.09 
 
 
705 aa  300  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  35 
 
 
810 aa  296  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.3 
 
 
1285 aa  291  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  37.56 
 
 
1257 aa  290  9e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  36.44 
 
 
800 aa  287  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  37.07 
 
 
1161 aa  285  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 
1322 aa  284  6.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 
1127 aa  282  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3493  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  37.5 
 
 
872 aa  274  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.04 
 
 
1090 aa  274  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 
1090 aa  274  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 
1002 aa  269  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.08 
 
 
1611 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
1099 aa  268  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  34.83 
 
 
998 aa  267  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  38 
 
 
1028 aa  268  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 
1154 aa  267  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  33.46 
 
 
777 aa  266  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 
977 aa  266  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 
1578 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3445  putative PAS/PAC sensor protein  39.37 
 
 
608 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  35.58 
 
 
1153 aa  265  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 
1178 aa  265  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2671  putative PAS/PAC sensor protein  39.37 
 
 
608 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 
1146 aa  265  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
1051 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 
1068 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
1187 aa  265  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 
841 aa  263  8e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
1026 aa  263  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  33.26 
 
 
1125 aa  261  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.8 
 
 
1130 aa  261  5.0000000000000005e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.9 
 
 
1131 aa  259  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
1128 aa  259  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
1173 aa  258  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  35.7 
 
 
1560 aa  258  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  36.12 
 
 
787 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
633 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 
1197 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 
1068 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2976  two-component hybrid sensor and regulator  36.82 
 
 
1132 aa  255  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.210238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  32.54 
 
 
1128 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 
1130 aa  252  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.44 
 
 
1127 aa  252  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
1126 aa  251  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
1202 aa  251  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 
759 aa  250  9e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  32.86 
 
 
631 aa  250  9e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
860 aa  249  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 
817 aa  247  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  33.97 
 
 
620 aa  247  6.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 
970 aa  247  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.95 
 
 
655 aa  247  8e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
1002 aa  247  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 
1070 aa  247  9e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
1002 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  33.06 
 
 
659 aa  246  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  32.35 
 
 
1124 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0670  sensor histidine kinase/response regulator  32.24 
 
 
1170 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.315036  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  31.67 
 
 
1121 aa  245  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
1350 aa  245  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.71 
 
 
717 aa  245  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 
844 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
945 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 
844 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
913 aa  244  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
816 aa  244  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 
846 aa  243  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  36.12 
 
 
900 aa  243  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 
1255 aa  242  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>