More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1001 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
674 aa  1377    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  91.4 
 
 
932 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  43.54 
 
 
937 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2807  putative PAS/PAC sensor protein  43.22 
 
 
730 aa  346  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.135813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 
912 aa  333  6e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 
790 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  38.43 
 
 
967 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  38.43 
 
 
967 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  38.55 
 
 
705 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  34 
 
 
1119 aa  277  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3493  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  37.12 
 
 
872 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  32.41 
 
 
1207 aa  244  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  55.36 
 
 
1183 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
816 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  42.38 
 
 
585 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.59 
 
 
1058 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  30.2 
 
 
1133 aa  234  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  33.26 
 
 
1130 aa  232  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 
1078 aa  230  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2671  putative PAS/PAC sensor protein  34.38 
 
 
608 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3445  putative PAS/PAC sensor protein  34.38 
 
 
608 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
1026 aa  223  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4666  putative PAS/PAC sensor protein  32.09 
 
 
608 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169254  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  50.68 
 
 
913 aa  217  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0131  Cache domain protein  35.91 
 
 
354 aa  214  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
935 aa  209  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
945 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  51.39 
 
 
1051 aa  204  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 
1654 aa  183  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  43.58 
 
 
681 aa  183  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
964 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 
815 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  43.52 
 
 
744 aa  180  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  41.95 
 
 
839 aa  179  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
488 aa  177  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
764 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 
1093 aa  174  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 
1093 aa  173  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  46.46 
 
 
3706 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 
1253 aa  172  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  43.84 
 
 
1668 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  42.6 
 
 
526 aa  171  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  40.37 
 
 
1239 aa  170  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
347 aa  169  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 
572 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
771 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
1390 aa  167  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 
991 aa  167  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 
1051 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 
1714 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  44.12 
 
 
1663 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5074  signal transduction histidine kinase  44.7 
 
 
479 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 
613 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 
1177 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  39.64 
 
 
783 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  44.85 
 
 
439 aa  160  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 
1560 aa  160  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 
941 aa  160  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 
551 aa  157  9e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 
547 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 
215 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 
2693 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  36.36 
 
 
918 aa  154  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
382 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
343 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  35.68 
 
 
1248 aa  150  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
657 aa  150  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
767 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  35.24 
 
 
754 aa  150  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 
771 aa  150  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  41.58 
 
 
1676 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4664  putative sensor with HAMP domain protein  27.96 
 
 
491 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0372339  normal  0.32325 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 
732 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
1246 aa  148  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 
872 aa  147  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  34.04 
 
 
1182 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 
727 aa  147  9e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  36.17 
 
 
676 aa  144  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
788 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4665  putative sensor with HAMP domain protein  26.13 
 
 
482 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  33.48 
 
 
449 aa  144  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
532 aa  143  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  35.51 
 
 
1289 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  34.03 
 
 
657 aa  142  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  35.65 
 
 
945 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
723 aa  141  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3247  sensory transduction histidine kinase  35.32 
 
 
746 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0645212 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001909  GGDEF family protein  24.65 
 
 
848 aa  140  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 
980 aa  140  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  35.71 
 
 
704 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
878 aa  139  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
834 aa  138  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 
909 aa  137  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  30.99 
 
 
892 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1227 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  30.53 
 
 
682 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  33.95 
 
 
886 aa  135  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  32.35 
 
 
819 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  33.48 
 
 
936 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
749 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.164522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>