More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3699 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  100 
 
 
998 aa  2052    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.29 
 
 
977 aa  851    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  52.39 
 
 
970 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.07 
 
 
858 aa  504  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.92 
 
 
917 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  36.1 
 
 
910 aa  445  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 
791 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.49 
 
 
927 aa  436  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.44 
 
 
991 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.18 
 
 
796 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.61 
 
 
798 aa  412  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.98 
 
 
984 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  42.89 
 
 
792 aa  399  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 
803 aa  399  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 
1003 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 
1022 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 
975 aa  368  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
974 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 
687 aa  343  9e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  38.3 
 
 
1361 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.54 
 
 
823 aa  339  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 
1362 aa  332  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  36.26 
 
 
1046 aa  318  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
1271 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.98 
 
 
702 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 
755 aa  308  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.26 
 
 
1352 aa  303  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  29.61 
 
 
1214 aa  296  9e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  33.88 
 
 
1196 aa  294  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  32.51 
 
 
1137 aa  289  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.87 
 
 
699 aa  287  7e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.93 
 
 
574 aa  287  8e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  47.81 
 
 
575 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
1137 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1336  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  35.99 
 
 
740 aa  281  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000730785  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.53 
 
 
718 aa  281  5e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 
1145 aa  280  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 
1143 aa  279  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
1141 aa  278  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  32.04 
 
 
1170 aa  276  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 
1172 aa  276  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.11 
 
 
1839 aa  275  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 
1064 aa  274  7e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 
1203 aa  273  9e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 
1201 aa  273  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 
1163 aa  273  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.6 
 
 
569 aa  273  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0148365  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.23 
 
 
1266 aa  273  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1077  sensory box/GGDEF family protein  34.67 
 
 
808 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 
2099 aa  272  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  31.93 
 
 
1172 aa  271  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  51.49 
 
 
395 aa  271  5e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 
1680 aa  270  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
2099 aa  270  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  36.77 
 
 
659 aa  270  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.95 
 
 
1165 aa  269  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 
1857 aa  269  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  33.61 
 
 
923 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  32.3 
 
 
1937 aa  268  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 
1937 aa  268  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 
937 aa  267  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.72 
 
 
1158 aa  267  7e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.66 
 
 
1149 aa  267  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
699 aa  266  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 
1917 aa  266  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2467  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  32.82 
 
 
729 aa  265  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 
1216 aa  265  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 
1356 aa  265  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.26 
 
 
641 aa  265  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.03 
 
 
785 aa  265  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 
1267 aa  263  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
1954 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.47 
 
 
577 aa  263  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 
1038 aa  262  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  31.88 
 
 
1200 aa  262  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 
1155 aa  262  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.64 
 
 
1155 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  34.69 
 
 
977 aa  261  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
1168 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.55 
 
 
1037 aa  260  8e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
1936 aa  260  8e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
1643 aa  259  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 
1284 aa  260  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.64 
 
 
1155 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 
1310 aa  259  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.4 
 
 
989 aa  258  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 
981 aa  259  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 
1303 aa  258  4e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  30.61 
 
 
1158 aa  258  5e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 
1896 aa  258  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3046  putative PAS/PAC sensor protein  37.11 
 
 
660 aa  257  8e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 
579 aa  256  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  31.12 
 
 
1695 aa  255  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.9 
 
 
858 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 
1195 aa  254  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 
1713 aa  252  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  31.32 
 
 
1161 aa  252  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.66 
 
 
1155 aa  251  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
1691 aa  250  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 
1765 aa  249  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>