More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0615 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
395 aa  798    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  52.41 
 
 
575 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.38 
 
 
574 aa  272  6e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  51.49 
 
 
998 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  51.31 
 
 
970 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.93 
 
 
977 aa  265  8e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.82 
 
 
858 aa  263  4e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.03 
 
 
569 aa  263  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0148365  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.62 
 
 
917 aa  262  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  51.89 
 
 
927 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.2 
 
 
633 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.45 
 
 
791 aa  256  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
785 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  44.14 
 
 
910 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.95 
 
 
641 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
677 aa  237  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 
631 aa  234  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.08 
 
 
577 aa  233  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  36.5 
 
 
663 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 
699 aa  230  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 
1022 aa  229  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 
386 aa  229  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000238922  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 
596 aa  229  7e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 
579 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 
1691 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  46.86 
 
 
792 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.86 
 
 
803 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 
668 aa  221  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.25 
 
 
798 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  43.88 
 
 
1346 aa  219  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.86 
 
 
984 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0064  histidine kinase  33.82 
 
 
598 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.08 
 
 
796 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.96 
 
 
1003 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  37.19 
 
 
544 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1421  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
404 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.55 
 
 
687 aa  212  9e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  45.74 
 
 
1046 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.61 
 
 
991 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
975 aa  209  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.18 
 
 
1069 aa  209  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 
557 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.125124  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.96 
 
 
1193 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.3 
 
 
763 aa  207  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.88 
 
 
1310 aa  207  4e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.96 
 
 
1193 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.91 
 
 
846 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
389 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  35.03 
 
 
528 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  33.25 
 
 
544 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  43.12 
 
 
923 aa  203  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  41.61 
 
 
810 aa  203  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.87 
 
 
1452 aa  203  5e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 
767 aa  202  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  41.95 
 
 
1028 aa  202  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.12 
 
 
781 aa  202  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.55 
 
 
1369 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 
769 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 
882 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2327  ATP-binding region ATPase domain protein  39.02 
 
 
758 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  41.72 
 
 
803 aa  200  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.56 
 
 
1398 aa  199  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 
1877 aa  199  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.97 
 
 
1267 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3020  histidine kinase  37.89 
 
 
631 aa  199  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000249854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  45.82 
 
 
661 aa  199  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.14 
 
 
1765 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
765 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.49 
 
 
1313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 
646 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.81 
 
 
1442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 
1959 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 
616 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.315862  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  40.98 
 
 
1392 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  37.38 
 
 
539 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.6 
 
 
1271 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.06 
 
 
881 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 
973 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 
956 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  39.62 
 
 
882 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 
772 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0496  histidine kinase  43.98 
 
 
554 aa  196  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434752 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  43.02 
 
 
853 aa  196  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 
1165 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.26 
 
 
1287 aa  196  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 
758 aa  196  8.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  42.41 
 
 
823 aa  195  9e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3723  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 
903 aa  195  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.803649  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 
1127 aa  195  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.37 
 
 
1303 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  44.57 
 
 
896 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
974 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.82 
 
 
896 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1561  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
443 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
774 aa  195  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1400 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  44.57 
 
 
896 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  44.57 
 
 
896 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 
995 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  37.03 
 
 
751 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>