More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0544 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
569 aa  1140    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0148365  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 
575 aa  364  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 
574 aa  343  4e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  49.3 
 
 
970 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  45.6 
 
 
998 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  52.03 
 
 
395 aa  271  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.82 
 
 
977 aa  262  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55 
 
 
633 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.85 
 
 
791 aa  260  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.96 
 
 
858 aa  258  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  48.03 
 
 
910 aa  251  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.72 
 
 
917 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.67 
 
 
785 aa  240  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 
699 aa  240  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.38 
 
 
798 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.77 
 
 
1022 aa  236  6e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.48 
 
 
927 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  47.72 
 
 
792 aa  230  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.72 
 
 
803 aa  230  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.76 
 
 
796 aa  229  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.8 
 
 
1003 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.11 
 
 
631 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.23 
 
 
577 aa  225  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 
641 aa  223  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.4 
 
 
386 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000238922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  40.06 
 
 
576 aa  217  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
596 aa  213  9e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0496  histidine kinase  35.85 
 
 
554 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434752 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 
932 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
646 aa  211  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
579 aa  210  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.33 
 
 
991 aa  210  6e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.81 
 
 
984 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.5 
 
 
853 aa  208  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 
557 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.125124  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 
1240 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 
835 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  37.29 
 
 
659 aa  204  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.26 
 
 
1433 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 
581 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00493244  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.29 
 
 
687 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 
1240 aa  200  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
923 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 
631 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  45.05 
 
 
544 aa  198  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  36.9 
 
 
891 aa  198  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
780 aa  198  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
827 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  42.81 
 
 
1028 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 
1193 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  39.21 
 
 
565 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 
1193 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.23 
 
 
774 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.2 
 
 
1691 aa  196  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
909 aa  195  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.14 
 
 
765 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.25 
 
 
1177 aa  194  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 
937 aa  194  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  40.68 
 
 
1120 aa  194  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.13 
 
 
1314 aa  194  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 
568 aa  194  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  37.03 
 
 
1014 aa  194  5e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 
667 aa  194  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 
995 aa  194  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 
881 aa  193  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.3 
 
 
1271 aa  193  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1369  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.15 
 
 
767 aa  193  8e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0713189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  38.41 
 
 
896 aa  193  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.16 
 
 
1768 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.75 
 
 
1767 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.75 
 
 
1767 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3308  sensor histidine kinase  33.83 
 
 
845 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
1765 aa  192  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
940 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.94 
 
 
1109 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  37.75 
 
 
896 aa  192  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.24 
 
 
762 aa  192  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.36 
 
 
1767 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.73 
 
 
1350 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  42.46 
 
 
1135 aa  191  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 
817 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 
1124 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.14 
 
 
2213 aa  191  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  34.9 
 
 
651 aa  191  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.1 
 
 
1550 aa  190  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  38.08 
 
 
896 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  34.12 
 
 
508 aa  190  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.14 
 
 
896 aa  190  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  42.48 
 
 
1763 aa  190  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  37.75 
 
 
896 aa  190  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  37.75 
 
 
896 aa  190  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  40.33 
 
 
803 aa  189  8e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  43.7 
 
 
1765 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  37.75 
 
 
896 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.91 
 
 
860 aa  189  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  39.85 
 
 
882 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  37.75 
 
 
896 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  37.91 
 
 
751 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 
1369 aa  188  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 
1064 aa  188  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>