More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0135 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
858 aa  1766    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  49.15 
 
 
977 aa  526  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  40.92 
 
 
800 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  49.07 
 
 
998 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  48.82 
 
 
970 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.08 
 
 
796 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.34 
 
 
927 aa  445  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.56 
 
 
791 aa  440  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.01 
 
 
798 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.92 
 
 
917 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  44.12 
 
 
792 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.12 
 
 
803 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 
1022 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.26 
 
 
991 aa  405  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.21 
 
 
975 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.9 
 
 
984 aa  395  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.58 
 
 
974 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 
1003 aa  392  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  35.8 
 
 
910 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.31 
 
 
823 aa  365  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  35.75 
 
 
1361 aa  348  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.91 
 
 
687 aa  345  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  37.55 
 
 
1046 aa  341  4e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 
1362 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
1271 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 
755 aa  322  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
1172 aa  299  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 
1356 aa  298  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 
1195 aa  294  6e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 
944 aa  293  7e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 
827 aa  289  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  33.33 
 
 
1137 aa  288  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 
1143 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 
1177 aa  286  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
1352 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 
1141 aa  282  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 
1137 aa  281  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  34.18 
 
 
1161 aa  278  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 
1839 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  29.99 
 
 
835 aa  274  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  32.21 
 
 
1278 aa  273  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
2107 aa  272  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 
1680 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
1782 aa  271  4e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 
1937 aa  271  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 
2099 aa  271  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
1166 aa  271  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  32.48 
 
 
1937 aa  271  5e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
1155 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  32.61 
 
 
1695 aa  270  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 
575 aa  270  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
981 aa  269  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 
574 aa  269  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 
1713 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 
2099 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.77 
 
 
1203 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 
1896 aa  268  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  31.44 
 
 
1374 aa  266  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 
1936 aa  265  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 
1159 aa  265  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 
1917 aa  264  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  31.63 
 
 
1200 aa  264  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 
1954 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.82 
 
 
395 aa  263  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  31.85 
 
 
1196 aa  262  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  33.72 
 
 
923 aa  261  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
1142 aa  261  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 
1161 aa  260  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 
920 aa  260  9e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 
1267 aa  259  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 
1037 aa  258  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.15 
 
 
785 aa  258  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
1771 aa  257  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 
569 aa  256  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0148365  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  30.85 
 
 
1172 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 
1333 aa  255  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  32.83 
 
 
1765 aa  254  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.06 
 
 
1053 aa  255  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 
1937 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1201 aa  254  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 
1064 aa  254  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  32.41 
 
 
1763 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.78 
 
 
2213 aa  254  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 
1767 aa  254  6e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 
1767 aa  254  7e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 
1165 aa  253  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 
1002 aa  253  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.34 
 
 
1163 aa  253  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
1145 aa  253  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  34.22 
 
 
1364 aa  253  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
1195 aa  252  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 
1284 aa  252  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  31.35 
 
 
1158 aa  252  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  31.15 
 
 
1170 aa  251  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
1643 aa  251  4e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
1767 aa  251  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 
1038 aa  251  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 
1310 aa  249  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.64 
 
 
386 aa  249  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000238922  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.95 
 
 
1168 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>