More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3446 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 791 aa  1608    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.56 
 
 		 977 aa  459  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.56 
 
 		 858 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  45.7 
 
 		 970 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  41.38 
 
 		 998 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.83 
 
 		 917 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.37 
 
 		 927 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.97 
 
 		 796 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  38.65 
 
 		 910 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.38 
 
 		 991 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.91 
 
 		 798 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.09 
 
 		 803 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  43.09 
 
 		 792 aa  385  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.89 
 
 		 984 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.14 
 
 		 1022 aa  362  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 		 1003 aa  362  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.99 
 
 		 974 aa  361  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 975 aa  348  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 687 aa  341  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 		 1271 aa  335  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 1046 aa  334  4e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 		 1356 aa  316  8e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 		 823 aa  311  4e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  37.88 
 
 		 1361 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 		 755 aa  305  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 		 1362 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 		 1839 aa  303  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 		 1954 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 		 1352 aa  293  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 		 1145 aa  287  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 		 1917 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 		 575 aa  282  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 		 1141 aa  282  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 		 1172 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 		 1896 aa  281  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1216 aa  279  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.52 
 
 		 574 aa  277  5e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 1143 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 		 2099 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  33.04 
 
 		 1158 aa  274  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 		 1038 aa  274  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  35.91 
 
 		 1937 aa  273  7e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 		 1937 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 1713 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  34.23 
 
 		 1161 aa  273  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 		 2099 aa  273  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  33.86 
 
 		 1196 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1936 aa  270  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 		 1195 aa  270  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  32.39 
 
 		 1001 aa  269  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 2107 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 1165 aa  268  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 1237 aa  268  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 1142 aa  267  5e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 		 1680 aa  266  8e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 1168 aa  266  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 		 1124 aa  266  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 		 1937 aa  265  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 		 1155 aa  265  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  33.28 
 
 		 1374 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  33.81 
 
 		 1695 aa  263  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 		 1310 aa  262  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 		 1163 aa  260  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  32.44 
 
 		 1137 aa  259  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 1267 aa  259  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.85 
 
 		 569 aa  259  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0148365  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 1768 aa  258  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.45 
 
 		 395 aa  256  9e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.39 
 
 		 1053 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 		 1201 aa  256  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 		 1158 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 1166 aa  256  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.57 
 
 		 1137 aa  256  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.06 
 
 		 1203 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 1236 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 1765 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  33.33 
 
 		 1172 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 		 1064 aa  254  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 1149 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 		 1964 aa  254  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  33.02 
 
 		 1170 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 1159 aa  253  9.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 1782 aa  252  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 1165 aa  251  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.52 
 
 		 785 aa  251  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1363 aa  251  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 1238 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.23 
 
 		 1442 aa  251  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 		 1236 aa  251  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 1238 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 		 1236 aa  251  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 		 1236 aa  251  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 		 1155 aa  251  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 1155 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  33.75 
 
 		 1188 aa  250  9e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.36 
 
 		 386 aa  250  9e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000238922  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 		 1238 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 		 1611 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 		 1238 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 		 1234 aa  249  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>