More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1722 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  100 
 
 		 1361 aa  2736    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  91.04 
 
 		 1362 aa  2492    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.51 
 
 		 1356 aa  403  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 823 aa  392  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 		 1839 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  33.76 
 
 		 1137 aa  380  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 		 1195 aa  379  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 1896 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 1137 aa  380  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 		 1936 aa  373  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 		 1937 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 		 1216 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  31.17 
 
 		 1937 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  30.19 
 
 		 1200 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 		 1159 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 		 1142 aa  366  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.87 
 
 		 1143 aa  365  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  30.28 
 
 		 1695 aa  365  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  29.96 
 
 		 1170 aa  365  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 1168 aa  365  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  27.46 
 
 		 1374 aa  363  8e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 1149 aa  362  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 		 1158 aa  361  7e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 		 1145 aa  360  9e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 		 1917 aa  360  9e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  28.62 
 
 		 1161 aa  358  5e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.01 
 
 		 1155 aa  357  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 		 1680 aa  357  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 		 2107 aa  357  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 		 1155 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 		 1038 aa  355  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.88 
 
 		 2099 aa  355  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.29 
 
 		 1155 aa  354  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 		 1177 aa  352  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 		 1713 aa  352  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 		 1141 aa  351  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  30.06 
 
 		 1196 aa  351  5e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.51 
 
 		 687 aa  351  7e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 		 1163 aa  350  8e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 		 1203 aa  350  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 		 858 aa  348  3e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  31.55 
 
 		 1158 aa  348  4e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.76 
 
 		 975 aa  348  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.56 
 
 		 2099 aa  345  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.49 
 
 		 1954 aa  345  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 		 1937 aa  345  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 		 1155 aa  343  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 		 974 aa  342  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 977 aa  341  7e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  38.3 
 
 		 998 aa  340  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.96 
 
 		 1194 aa  340  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  28.86 
 
 		 1172 aa  340  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.65 
 
 		 917 aa  339  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 		 1161 aa  336  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.92 
 
 		 1201 aa  335  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  27.79 
 
 		 1278 aa  334  7.000000000000001e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 		 927 aa  334  8e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 		 1022 aa  330  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 		 970 aa  328  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.44 
 
 		 1271 aa  328  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 		 1037 aa  325  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 		 1165 aa  323  9.000000000000001e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 		 1172 aa  318  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.66 
 
 		 2037 aa  318  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 1782 aa  318  6e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 1361 aa  314  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 1237 aa  313  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 		 991 aa  312  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 		 1189 aa  312  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.78 
 
 		 1158 aa  311  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.54 
 
 		 1131 aa  311  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 		 1162 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.88 
 
 		 791 aa  309  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 1003 aa  303  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 1046 aa  300  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 1352 aa  299  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 		 796 aa  297  9e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 		 1964 aa  291  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 		 2010 aa  291  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 		 755 aa  291  7e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.16 
 
 		 1942 aa  289  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 		 1160 aa  289  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  29.01 
 
 		 896 aa  286  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  39.71 
 
 		 792 aa  285  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.71 
 
 		 803 aa  285  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  28.23 
 
 		 896 aa  284  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 		 1792 aa  282  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 		 798 aa  282  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  28.99 
 
 		 896 aa  282  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.92 
 
 		 984 aa  282  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  32.66 
 
 		 910 aa  282  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  31.07 
 
 		 1392 aa  281  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 		 922 aa  281  6e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  29.28 
 
 		 896 aa  280  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  29.14 
 
 		 896 aa  280  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 		 1853 aa  278  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  33.89 
 
 		 896 aa  279  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  33.7 
 
 		 896 aa  278  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  33.7 
 
 		 896 aa  278  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 		 1816 aa  277  9e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>