More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2377 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1124 aa  2254    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.23 
 
 		 1130 aa  587  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.9 
 
 		 921 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 1550 aa  420  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 		 1384 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.99 
 
 		 1820 aa  415  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 		 925 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 		 801 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 		 950 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  44.65 
 
 		 1407 aa  406  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 		 936 aa  396  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 977 aa  393  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.64 
 
 		 1369 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 1069 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 		 1326 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 		 946 aa  385  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.79 
 
 		 2213 aa  382  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  43.15 
 
 		 1346 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  37.56 
 
 		 1014 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  40 
 
 		 1177 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 		 1305 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.57 
 
 		 916 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 		 816 aa  372  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.26 
 
 		 929 aa  369  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.27 
 
 		 1499 aa  365  3e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.09 
 
 		 923 aa  364  6e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  37.37 
 
 		 1001 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.47 
 
 		 1363 aa  362  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 1768 aa  362  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  35.4 
 
 		 1574 aa  361  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.03 
 
 		 1313 aa  362  3e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 1165 aa  361  4e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 		 1118 aa  361  4e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  42.47 
 
 		 847 aa  360  7e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 		 1767 aa  360  8e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1548 aa  360  9e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 		 1767 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 1480 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 		 1611 aa  355  2e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.67 
 
 		 1331 aa  354  4e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.23 
 
 		 1397 aa  355  4e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 1240 aa  354  5e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.99 
 
 		 1442 aa  353  8e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  42.57 
 
 		 977 aa  353  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 		 1255 aa  353  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.56 
 
 		 1131 aa  353  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  35.95 
 
 		 2035 aa  353  1e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  33.24 
 
 		 1683 aa  352  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 1767 aa  352  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 957 aa  351  4e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.14 
 
 		 1468 aa  351  5e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 		 833 aa  350  6e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 1245 aa  350  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 		 1202 aa  348  4e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 		 1622 aa  347  5e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 		 1782 aa  348  5e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 		 1072 aa  347  7e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 		 1771 aa  345  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 1267 aa  343  9e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 		 1784 aa  343  9e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  36.73 
 
 		 861 aa  343  9e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.34 
 
 		 887 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 		 1238 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 		 1238 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  35.35 
 
 		 1765 aa  341  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.57 
 
 		 1238 aa  341  5e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.61 
 
 		 1109 aa  341  5e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 		 1236 aa  340  8e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 		 1126 aa  340  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 		 1692 aa  340  9e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.73 
 
 		 812 aa  339  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  36.6 
 
 		 1763 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 		 1236 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  35.35 
 
 		 1135 aa  339  9.999999999999999e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 		 1236 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 		 1033 aa  339  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 1240 aa  339  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 957 aa  339  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.05 
 
 		 830 aa  338  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  35.92 
 
 		 1179 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.57 
 
 		 1238 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  35.78 
 
 		 1322 aa  338  3.9999999999999995e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 1310 aa  338  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 1765 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 		 1040 aa  337  7.999999999999999e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.26 
 
 		 1234 aa  337  7.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  37.76 
 
 		 1188 aa  336  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 		 682 aa  337  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  39.22 
 
 		 1053 aa  337  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 1009 aa  336  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  40.86 
 
 		 758 aa  336  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  38.72 
 
 		 850 aa  336  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  36.77 
 
 		 1439 aa  335  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 1284 aa  336  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 1203 aa  335  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 		 1398 aa  335  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 		 1258 aa  335  3e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 		 835 aa  335  4e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  39.86 
 
 		 852 aa  333  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 		 818 aa  333  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>