More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0943 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.09 
 
 
1820 aa  639    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1384 aa  2824    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.28 
 
 
925 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.28 
 
 
950 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.92 
 
 
936 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 
1305 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.63 
 
 
801 aa  504  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.14 
 
 
887 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 
1069 aa  444  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 
1550 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  41.79 
 
 
1407 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
1369 aa  422  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
1397 aa  416  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.2 
 
 
812 aa  413  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 
1692 aa  405  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
1313 aa  401  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 
1124 aa  396  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 
830 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
1398 aa  393  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  39.25 
 
 
1346 aa  393  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4447  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 
1878 aa  393  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.516196  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  41.32 
 
 
847 aa  392  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 
1202 aa  393  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
977 aa  388  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.93 
 
 
1040 aa  385  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  40.78 
 
 
758 aa  382  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 
946 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 
1118 aa  380  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 
921 aa  379  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
816 aa  376  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
929 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 
1363 aa  376  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  34.86 
 
 
1135 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 
1130 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 
682 aa  372  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  33.51 
 
 
1014 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.61 
 
 
1442 aa  370  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 
1767 aa  363  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  33.76 
 
 
1001 aa  363  1e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
1310 aa  362  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
1768 aa  362  3e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 
1767 aa  362  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  36.02 
 
 
1763 aa  359  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 
818 aa  359  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
916 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 
1767 aa  357  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  34.75 
 
 
1765 aa  356  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
1326 aa  356  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 
1480 aa  354  7e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.26 
 
 
1499 aa  354  8e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 
1267 aa  353  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 
1771 aa  352  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 
1765 aa  352  4e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  30.55 
 
 
1177 aa  350  8e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 
818 aa  350  8e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 
1245 aa  350  8e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
1240 aa  349  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.56 
 
 
1331 aa  348  5e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 
1784 aa  347  7e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
705 aa  347  8e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 
1072 aa  346  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1786 aa  346  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
1255 aa  345  4e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
1782 aa  345  4e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 
957 aa  344  8e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 
1792 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 
993 aa  341  5e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
1622 aa  340  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 
1165 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  35.86 
 
 
977 aa  338  5e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  32.54 
 
 
1574 aa  338  5e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 
876 aa  337  7e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
1548 aa  337  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 
2654 aa  337  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
1090 aa  335  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.26 
 
 
2213 aa  335  4e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 
1611 aa  335  5e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  29.6 
 
 
2035 aa  334  6e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 
833 aa  334  8e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.45 
 
 
1266 aa  333  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  35.58 
 
 
765 aa  332  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 
835 aa  332  4e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 
1340 aa  331  5.0000000000000004e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  31.69 
 
 
852 aa  329  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 
1433 aa  328  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 
1284 aa  327  8.000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  31.98 
 
 
750 aa  327  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  35.81 
 
 
1030 aa  327  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 
991 aa  326  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  32.71 
 
 
1683 aa  325  4e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 
957 aa  324  6e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  36.13 
 
 
1179 aa  324  8e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
1033 aa  323  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 
770 aa  323  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 
928 aa  323  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  32.71 
 
 
850 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
1236 aa  323  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
1236 aa  323  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
1236 aa  322  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  33.08 
 
 
1653 aa  322  3.9999999999999996e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>