More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4447 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4447  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1878 aa  3841    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.516196  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 
1820 aa  595  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 
887 aa  483  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 
1384 aa  393  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
950 aa  363  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
925 aa  362  3e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
936 aa  352  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 
1069 aa  303  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 
1369 aa  300  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 
830 aa  281  9e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  30.9 
 
 
1135 aa  280  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 
1398 aa  274  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
1305 aa  264  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 
758 aa  261  6e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  29 
 
 
1040 aa  260  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  27.23 
 
 
1014 aa  254  9.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.93 
 
 
977 aa  253  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.23 
 
 
1240 aa  242  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  28.7 
 
 
847 aa  240  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.39 
 
 
1128 aa  237  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.71 
 
 
1550 aa  234  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 
1363 aa  233  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.1 
 
 
1326 aa  230  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 
705 aa  229  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0909  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.87 
 
 
876 aa  228  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138917  normal  0.894742 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  26.83 
 
 
923 aa  224  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  27.16 
 
 
1763 aa  224  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 
920 aa  221  7.999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 
818 aa  217  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.48 
 
 
1284 aa  217  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  27.18 
 
 
852 aa  213  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.01 
 
 
1266 aa  212  6e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.38 
 
 
770 aa  211  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.91 
 
 
1433 aa  211  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.36 
 
 
1131 aa  211  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 
1090 aa  209  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.22 
 
 
1331 aa  208  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0963  histidine kinase  25.85 
 
 
737 aa  208  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.07 
 
 
1316 aa  207  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.4 
 
 
1234 aa  206  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.73 
 
 
1310 aa  206  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  27.48 
 
 
765 aa  204  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.42 
 
 
1072 aa  204  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  28.96 
 
 
861 aa  202  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.22 
 
 
1009 aa  202  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.83 
 
 
1255 aa  200  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.66 
 
 
991 aa  198  9e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  28.37 
 
 
1322 aa  198  9e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.8 
 
 
1603 aa  198  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.48 
 
 
1643 aa  198  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  27.61 
 
 
1351 aa  196  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.69 
 
 
1303 aa  192  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.38 
 
 
1313 aa  191  8e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.73 
 
 
1560 aa  192  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.2 
 
 
1433 aa  190  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.8 
 
 
981 aa  189  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64230  RetS (regulator of exopolysaccharide and Type III secretion)  25.11 
 
 
942 aa  187  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0403381  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1876  histidine kinase  26.88 
 
 
979 aa  187  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0246829  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.51 
 
 
1303 aa  187  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.19 
 
 
1260 aa  186  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5576  sensor/response regulator hybrid  25.41 
 
 
962 aa  186  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3174  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.34 
 
 
1087 aa  186  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2105  PAS  28.2 
 
 
680 aa  185  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.88 
 
 
893 aa  183  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  25.97 
 
 
1626 aa  183  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0501  histidine kinase  27.24 
 
 
955 aa  183  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.31 
 
 
1021 aa  182  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  26.55 
 
 
1417 aa  182  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  26.09 
 
 
1418 aa  182  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  37.7 
 
 
1407 aa  180  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1120  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
577 aa  181  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 
682 aa  179  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 
1397 aa  179  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
801 aa  177  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2135  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
576 aa  175  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2091  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
563 aa  175  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 
690 aa  174  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 
1193 aa  173  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 
1193 aa  173  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 
1692 aa  172  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  36.57 
 
 
982 aa  172  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
885 aa  171  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.927565 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
1721 aa  171  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.41 
 
 
926 aa  170  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  26.3 
 
 
1287 aa  171  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.15 
 
 
1782 aa  170  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.61 
 
 
1442 aa  169  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3033  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
585 aa  169  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 
1340 aa  168  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  26.41 
 
 
850 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0025  histidine kinase  24.55 
 
 
849 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.53 
 
 
1016 aa  168  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 
816 aa  167  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4868  sensor histidine kinase/response regulator RetS  25.81 
 
 
929 aa  166  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0082  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.72 
 
 
866 aa  166  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0375698  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1357  cytoplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.38 
 
 
849 aa  165  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3442  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
593 aa  164  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 
921 aa  164  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 
1245 aa  164  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.57 
 
 
1691 aa  164  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>