More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0425 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 893 aa  1830    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 		 1064 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2282  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 		 685 aa  347  6e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 927 aa  340  5.9999999999999996e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 1202 aa  340  9e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 		 916 aa  339  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 1049 aa  336  9e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664054  normal  0.108682 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 		 1369 aa  334  5e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0298  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 		 899 aa  334  5e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0542846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 		 833 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  35.46 
 
 		 1763 aa  327  5e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  37.25 
 
 		 1135 aa  325  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.78 
 
 		 852 aa  324  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 		 649 aa  323  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 1101 aa  322  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 		 1267 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 		 1768 aa  321  3e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  32.06 
 
 		 1179 aa  319  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 816 aa  319  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 1118 aa  318  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 818 aa  318  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 		 1236 aa  317  6e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  36.64 
 
 		 1765 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 1582 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 		 818 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 		 1767 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 1398 aa  314  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 		 1165 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 		 1767 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  33.09 
 
 		 1200 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 1765 aa  313  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 1238 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 1611 aa  312  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 1238 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 		 1234 aa  312  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 		 1234 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 		 1238 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 		 1238 aa  311  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 		 1260 aa  311  4e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 		 1397 aa  311  5e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 1767 aa  310  9e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.31 
 
 		 1331 aa  308  3e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 1236 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 1236 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 1236 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1230 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.01 
 
 		 1442 aa  307  5.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 1771 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  35.1 
 
 		 1188 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  32.95 
 
 		 1236 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 636 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 		 929 aa  304  5.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.43 
 
 		 1233 aa  303  9e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 		 1310 aa  303  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.3 
 
 		 1363 aa  303  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 		 1784 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 		 1245 aa  301  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  36.85 
 
 		 1177 aa  300  6e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 		 757 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.95 
 
 		 932 aa  300  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 1782 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 		 1792 aa  299  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 1340 aa  298  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  30.76 
 
 		 1683 aa  298  4e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 		 1313 aa  298  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 1426 aa  297  5e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 		 1057 aa  297  8e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 1786 aa  296  9e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  34.6 
 
 		 932 aa  296  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  36.88 
 
 		 1014 aa  295  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  35.71 
 
 		 765 aa  295  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 946 aa  295  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 		 1203 aa  294  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 		 745 aa  294  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0416  histidine kinase  33.39 
 
 		 896 aa  294  6e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  38.16 
 
 		 905 aa  293  7e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  36.56 
 
 		 1346 aa  293  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 		 1433 aa  292  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 		 948 aa  291  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 936 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.71 
 
 		 1305 aa  291  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  32.2 
 
 		 1626 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  35.23 
 
 		 761 aa  291  5.0000000000000004e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1040 aa  290  6e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 		 1659 aa  290  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 925 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 		 778 aa  289  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 950 aa  290  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 993 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.3 
 
 		 969 aa  289  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 1059 aa  288  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 1266 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1128 aa  288  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 		 1550 aa  287  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 1251 aa  287  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 812 aa  287  5e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2813  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 1632 aa  287  5e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  36.07 
 
 		 977 aa  287  5.999999999999999e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 1255 aa  287  8e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 1021 aa  286  9e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>