More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1977 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.08 
 
 		 1090 aa  692    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1072 aa  2118    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  49.91 
 
 		 847 aa  478  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  49.91 
 
 		 977 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.54 
 
 		 1820 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 1369 aa  438  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 1326 aa  436  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 1363 aa  433  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.63 
 
 		 921 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 		 1069 aa  432  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  42.79 
 
 		 1177 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 		 1398 aa  423  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 1397 aa  424  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.69 
 
 		 977 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 		 1118 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 1622 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.79 
 
 		 1240 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  41.17 
 
 		 758 aa  411  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 		 1203 aa  410  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.17 
 
 		 1499 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.91 
 
 		 1433 aa  408  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.4 
 
 		 812 aa  408  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 		 1202 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  37.28 
 
 		 1014 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.71 
 
 		 705 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  39.64 
 
 		 923 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.63 
 
 		 1284 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  34.25 
 
 		 1683 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 		 1040 aa  395  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.18 
 
 		 1442 aa  393  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.07 
 
 		 1548 aa  396  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  43.12 
 
 		 750 aa  393  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.81 
 
 		 2213 aa  391  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.31 
 
 		 993 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  31.12 
 
 		 1765 aa  389  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 		 929 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.74 
 
 		 2654 aa  389  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  40.55 
 
 		 1346 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.39 
 
 		 1109 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 		 1767 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 		 1767 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 816 aa  382  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1611 aa  382  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 		 1550 aa  383  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 		 1480 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  35.56 
 
 		 1135 aa  383  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 		 1582 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 		 1165 aa  379  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.48 
 
 		 1266 aa  379  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 		 1767 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.57 
 
 		 1310 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.12 
 
 		 801 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 		 916 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.97 
 
 		 833 aa  376  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 1309 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.03 
 
 		 1771 aa  375  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 		 1245 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.55 
 
 		 1255 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  37.6 
 
 		 1763 aa  371  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  34.53 
 
 		 861 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 		 1384 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.97 
 
 		 1786 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 		 919 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.97 
 
 		 1792 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 		 1784 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 		 1782 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 1765 aa  369  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 946 aa  370  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1303 aa  369  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 		 990 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 		 1267 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  35.76 
 
 		 2035 aa  366  1e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 		 1130 aa  366  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.47 
 
 		 917 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 		 917 aa  365  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  35.11 
 
 		 1322 aa  365  3e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 		 1245 aa  364  5.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  38.51 
 
 		 1001 aa  364  6e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 		 818 aa  364  6e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  36.59 
 
 		 1179 aa  362  3e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 1768 aa  362  3e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.17 
 
 		 985 aa  361  4e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.31 
 
 		 1331 aa  361  4e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  37.24 
 
 		 1351 aa  359  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.26 
 
 		 1305 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 		 991 aa  358  2.9999999999999997e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.85 
 
 		 1468 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  39.24 
 
 		 1030 aa  358  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  27.01 
 
 		 1653 aa  357  5.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 		 917 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  38.47 
 
 		 917 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 		 922 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 		 818 aa  355  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 		 916 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 		 1166 aa  354  4e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 		 1193 aa  354  5e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 		 957 aa  354  5.9999999999999994e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.83 
 
 		 917 aa  353  8e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 1005 aa  353  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 		 778 aa  353  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>