More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1381 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 		 1468 aa  3015    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.38 
 
 		 1480 aa  1646    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 		 916 aa  589  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 1245 aa  513  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 		 1303 aa  488  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.61 
 
 		 1109 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  42.38 
 
 		 1653 aa  473  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  47.64 
 
 		 1351 aa  466  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.73 
 
 		 2213 aa  451  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  31.3 
 
 		 2035 aa  447  1e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.25 
 
 		 1363 aa  437  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 		 1118 aa  433  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 		 1326 aa  428  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 1560 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 812 aa  423  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.75 
 
 		 1040 aa  423  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.09 
 
 		 1550 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  39.2 
 
 		 861 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 		 1397 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 		 1369 aa  416  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.62 
 
 		 1331 aa  411  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  37.47 
 
 		 1763 aa  412  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  32.86 
 
 		 1765 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 1611 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  43.95 
 
 		 1346 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 1202 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  32.89 
 
 		 1177 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 		 1771 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 		 929 aa  403  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 977 aa  403  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  31.52 
 
 		 1135 aa  402  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1548 aa  399  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 		 1767 aa  400  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 1959 aa  398  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 1398 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 1042 aa  397  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 		 1768 aa  396  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 1267 aa  396  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 1069 aa  395  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 		 1767 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 		 1765 aa  396  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4645  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 		 948 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 921 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1767 aa  393  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  42.16 
 
 		 847 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 1333 aa  390  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 		 1310 aa  389  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 816 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  36.55 
 
 		 1014 aa  386  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 		 1582 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  31.92 
 
 		 1683 aa  383  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 		 946 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.87 
 
 		 1284 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.28 
 
 		 1499 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 		 1266 aa  382  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 1784 aa  383  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.03 
 
 		 1442 aa  383  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 		 1165 aa  380  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0290  histidine kinase  41.65 
 
 		 931 aa  378  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000039083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  33.5 
 
 		 1030 aa  379  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.26 
 
 		 1792 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 		 1782 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 		 833 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 		 835 aa  376  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 801 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 		 1625 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 		 1240 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 1786 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  32.84 
 
 		 1322 aa  368  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  36.95 
 
 		 1574 aa  369  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 		 950 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 		 990 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 1820 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 		 925 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.8 
 
 		 1426 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  41.1 
 
 		 923 aa  367  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.57 
 
 		 1397 aa  366  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  36.87 
 
 		 727 aa  366  1e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 1692 aa  365  3e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 1131 aa  365  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 		 705 aa  365  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 985 aa  364  8e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.29 
 
 		 1340 aa  363  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.56 
 
 		 1659 aa  362  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  37.02 
 
 		 1001 aa  361  5e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 		 1622 aa  360  8e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 1126 aa  360  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  29.44 
 
 		 1439 aa  359  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 936 aa  359  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  35.08 
 
 		 1021 aa  358  5e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 1009 aa  358  5.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  32.98 
 
 		 1417 aa  357  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  29.96 
 
 		 1626 aa  357  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.34 
 
 		 852 aa  357  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 2654 aa  357  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  42.14 
 
 		 758 aa  356  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 		 1229 aa  355  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 876 aa  355  4e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  32.37 
 
 		 1179 aa  355  4e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 		 1788 aa  355  5e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>