More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1650 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 917 aa  1850    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  70.37 
 
 		 917 aa  1260    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  66.56 
 
 		 925 aa  1123    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  71.46 
 
 		 917 aa  1285    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  96.62 
 
 		 917 aa  1710    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  90.1 
 
 		 919 aa  1577    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  75.08 
 
 		 922 aa  1324    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  99.35 
 
 		 917 aa  1836    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.39 
 
 		 956 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  64.54 
 
 		 905 aa  1069    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  66.67 
 
 		 925 aa  1121    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  70.47 
 
 		 916 aa  1226    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.29 
 
 		 937 aa  560  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.89 
 
 		 933 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.1 
 
 		 937 aa  558  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.54 
 
 		 933 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  36.63 
 
 		 932 aa  550  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.49 
 
 		 933 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.59 
 
 		 933 aa  552  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.43 
 
 		 932 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.8 
 
 		 935 aa  545  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.39 
 
 		 952 aa  544  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  37.9 
 
 		 918 aa  542  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 		 918 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.12 
 
 		 935 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  37.9 
 
 		 918 aa  542  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.9 
 
 		 918 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.9 
 
 		 918 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.9 
 
 		 918 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.9 
 
 		 918 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.62 
 
 		 935 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.9 
 
 		 918 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.08 
 
 		 929 aa  540  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.9 
 
 		 918 aa  541  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.92 
 
 		 932 aa  537  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.91 
 
 		 918 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.02 
 
 		 918 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.5 
 
 		 922 aa  536  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.23 
 
 		 933 aa  539  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.91 
 
 		 918 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.02 
 
 		 918 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.85 
 
 		 935 aa  535  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.8 
 
 		 918 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.58 
 
 		 927 aa  526  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.53 
 
 		 950 aa  527  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.99 
 
 		 906 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.9 
 
 		 929 aa  525  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.11 
 
 		 918 aa  519  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.81 
 
 		 941 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.65 
 
 		 918 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.35 
 
 		 928 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1635  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.3 
 
 		 930 aa  509  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.386153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.28 
 
 		 931 aa  504  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  35 
 
 		 942 aa  500  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.87 
 
 		 948 aa  498  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.95 
 
 		 921 aa  486  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.09 
 
 		 930 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.55 
 
 		 942 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.52 
 
 		 926 aa  449  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 		 936 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  30.37 
 
 		 910 aa  406  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  30.45 
 
 		 910 aa  405  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  36.57 
 
 		 1042 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1097  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.19 
 
 		 915 aa  365  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 		 921 aa  352  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 		 1326 aa  352  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 1202 aa  350  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 		 929 aa  345  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  35.21 
 
 		 1574 aa  344  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 1045 aa  344  5e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 		 1245 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  39.81 
 
 		 847 aa  343  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 		 1550 aa  340  7e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 		 1072 aa  339  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  34 
 
 		 833 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.71 
 
 		 923 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0347  putative signal transduction histidine kinase sensor  35.21 
 
 		 1135 aa  337  5e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 		 1266 aa  337  7e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  38.61 
 
 		 1346 aa  336  9e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 		 1165 aa  336  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.45 
 
 		 1363 aa  332  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  38.64 
 
 		 977 aa  333  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 		 1398 aa  332  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 1193 aa  332  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 		 920 aa  330  5.0000000000000004e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.73 
 
 		 2213 aa  330  8e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 1251 aa  330  8e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 		 909 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 1040 aa  329  1.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 1611 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1305 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  35.81 
 
 		 1014 aa  328  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 		 1767 aa  328  3e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1303 aa  328  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 1767 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 		 1397 aa  327  6e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 950 aa  327  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 		 899 aa  327  8.000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 		 985 aa  326  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.23 
 
 		 833 aa  326  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>