More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3355 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.22 
 
 		 930 aa  688    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  43.5 
 
 		 918 aa  701    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.41 
 
 		 918 aa  702    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.89 
 
 		 918 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.8 
 
 		 948 aa  709    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  66.52 
 
 		 935 aa  1243    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.54 
 
 		 926 aa  681    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.04 
 
 		 918 aa  736    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  81.11 
 
 		 937 aa  1558    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.41 
 
 		 918 aa  702    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.41 
 
 		 918 aa  702    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.42 
 
 		 931 aa  712    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.45 
 
 		 929 aa  768    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  66.99 
 
 		 935 aa  1244    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  67.16 
 
 		 933 aa  1252    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.48 
 
 		 918 aa  707    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  66.74 
 
 		 933 aa  1248    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.78 
 
 		 918 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  64.54 
 
 		 941 aa  1189    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.41 
 
 		 918 aa  702    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  62.45 
 
 		 950 aa  1171    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  67.16 
 
 		 933 aa  1251    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.39 
 
 		 932 aa  797    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  67.16 
 
 		 932 aa  1246    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.78 
 
 		 918 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  72.27 
 
 		 933 aa  1379    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  66.49 
 
 		 935 aa  1244    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  66.49 
 
 		 935 aa  1245    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  63.97 
 
 		 952 aa  1202    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.48 
 
 		 928 aa  714    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.41 
 
 		 918 aa  702    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.96 
 
 		 921 aa  697    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.67 
 
 		 918 aa  718    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  67.06 
 
 		 933 aa  1251    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.41 
 
 		 918 aa  702    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  71.43 
 
 		 929 aa  1342    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.86 
 
 		 927 aa  751    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  100 
 
 		 937 aa  1919    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  45.81 
 
 		 932 aa  794    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.41 
 
 		 918 aa  702    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.52 
 
 		 906 aa  736    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.57 
 
 		 942 aa  680    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.89 
 
 		 918 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.89 
 
 		 922 aa  725    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  43.5 
 
 		 918 aa  701    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.34 
 
 		 917 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.81 
 
 		 916 aa  562  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  38.31 
 
 		 925 aa  558  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  38.39 
 
 		 905 aa  554  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  38.42 
 
 		 925 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  36.81 
 
 		 917 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 		 922 aa  535  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 		 919 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.03 
 
 		 917 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.81 
 
 		 917 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 		 917 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  36.04 
 
 		 942 aa  462  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  31.34 
 
 		 910 aa  419  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 936 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  37.56 
 
 		 1042 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  30.5 
 
 		 910 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 		 1045 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.28 
 
 		 956 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 1611 aa  363  6e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1635  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 		 930 aa  353  7e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.386153  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 929 aa  351  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 		 835 aa  340  5.9999999999999996e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 		 909 aa  339  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  33.9 
 
 		 1014 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 		 1340 aa  335  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.23 
 
 		 1363 aa  328  4.0000000000000003e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 		 1788 aa  324  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 		 1622 aa  324  5e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 		 1767 aa  323  8e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 		 1767 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 		 1326 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 1069 aa  321  3.9999999999999996e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 758 aa  321  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  36.64 
 
 		 765 aa  320  6e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  30.84 
 
 		 923 aa  320  7e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 		 1771 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 1072 aa  320  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 		 1369 aa  320  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  33.85 
 
 		 1177 aa  319  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  36.3 
 
 		 977 aa  319  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 		 812 aa  318  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 		 1240 aa  317  7e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 1193 aa  317  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  32.58 
 
 		 1683 aa  315  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 		 1767 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 		 1397 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 816 aa  315  2.9999999999999996e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  31.7 
 
 		 833 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 		 1310 aa  314  4.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  31.92 
 
 		 1763 aa  314  5.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  36.29 
 
 		 1765 aa  314  5.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 		 977 aa  313  9e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 1266 aa  313  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 1005 aa  313  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1097  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.2 
 
 		 915 aa  313  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>