More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0813 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  60.99 
 
 
918 aa  1082    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  60.99 
 
 
918 aa  1082    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.25 
 
 
935 aa  709    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  79.04 
 
 
918 aa  1448    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.51 
 
 
948 aa  695    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  60.99 
 
 
918 aa  1082    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  60.93 
 
 
921 aa  1083    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.13 
 
 
935 aa  705    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.13 
 
 
933 aa  708    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  60.99 
 
 
918 aa  1082    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  70.94 
 
 
931 aa  1270    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.65 
 
 
933 aa  725    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  60.82 
 
 
918 aa  1088    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  61.03 
 
 
918 aa  1091    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  100 
 
 
922 aa  1887    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.21 
 
 
933 aa  709    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  59.6 
 
 
930 aa  1071    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.82 
 
 
929 aa  753    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  60.99 
 
 
918 aa  1082    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  59.05 
 
 
942 aa  1063    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.98 
 
 
950 aa  691    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  51.98 
 
 
932 aa  897    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  61.03 
 
 
918 aa  1091    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  69.86 
 
 
928 aa  1273    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.94 
 
 
937 aa  753    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  66.49 
 
 
906 aa  1169    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.46 
 
 
926 aa  734    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.72 
 
 
935 aa  699    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.93 
 
 
935 aa  701    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.23 
 
 
933 aa  710    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  60.99 
 
 
918 aa  1082    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.77 
 
 
952 aa  707    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.89 
 
 
937 aa  739    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.04 
 
 
941 aa  706    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  60.99 
 
 
918 aa  1082    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.92 
 
 
933 aa  702    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  60.95 
 
 
918 aa  1086    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  61.14 
 
 
918 aa  1092    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  60.99 
 
 
918 aa  1082    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  60.93 
 
 
918 aa  1090    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  51.18 
 
 
929 aa  895    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  52.45 
 
 
932 aa  911    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  60.99 
 
 
918 aa  1082    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.23 
 
 
932 aa  704    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  52.18 
 
 
927 aa  897    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  39.41 
 
 
917 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  39.34 
 
 
917 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 
922 aa  524  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 
919 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
916 aa  522  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  37.81 
 
 
905 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  37.53 
 
 
925 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 
917 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  37.67 
 
 
925 aa  512  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.54 
 
 
917 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.13 
 
 
917 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 
956 aa  488  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  32.78 
 
 
942 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 
936 aa  420  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1635  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
930 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.386153  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  29.47 
 
 
910 aa  399  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  35.46 
 
 
1042 aa  399  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  29.76 
 
 
910 aa  391  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 
1611 aa  348  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.35 
 
 
1331 aa  340  9e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  32.03 
 
 
1765 aa  340  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 
816 aa  339  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 
916 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 
1767 aa  337  7e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.66 
 
 
1767 aa  335  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 
1326 aa  333  7.000000000000001e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 
1266 aa  332  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 
1267 aa  331  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 
1193 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  32.55 
 
 
1763 aa  330  9e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  32.26 
 
 
1014 aa  328  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 
1767 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.37 
 
 
1582 aa  325  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.62 
 
 
920 aa  324  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.24 
 
 
1771 aa  323  7e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 
929 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  37.74 
 
 
1135 aa  323  9.999999999999999e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.13 
 
 
2213 aa  321  5e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.09 
 
 
852 aa  319  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 
1768 aa  319  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 
1397 aa  319  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.18 
 
 
1442 aa  319  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
964 aa  319  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
1165 aa  318  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.09 
 
 
1548 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  29.45 
 
 
833 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 
1765 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 
833 aa  315  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 
1784 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 
1782 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 
909 aa  313  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 
1157 aa  313  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128983  unclonable  0.00000000207996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.66 
 
 
1786 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 
1792 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 
1202 aa  310  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>