More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1250 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
936 aa  1917    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 
922 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  33.33 
 
 
905 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  31.97 
 
 
917 aa  439  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.91 
 
 
933 aa  439  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 
916 aa  439  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.15 
 
 
932 aa  438  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.98 
 
 
937 aa  435  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.92 
 
 
933 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.82 
 
 
933 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.58 
 
 
933 aa  430  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  31.45 
 
 
932 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.71 
 
 
933 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.28 
 
 
952 aa  430  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.82 
 
 
932 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  32.92 
 
 
917 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
917 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.1 
 
 
935 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.17 
 
 
935 aa  425  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.78 
 
 
935 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.31 
 
 
937 aa  426  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.89 
 
 
935 aa  425  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  33.59 
 
 
925 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.24 
 
 
928 aa  422  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.91 
 
 
941 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  32.7 
 
 
925 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.06 
 
 
929 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.29 
 
 
950 aa  421  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.66 
 
 
922 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.73 
 
 
927 aa  422  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.37 
 
 
919 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.72 
 
 
906 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  30.44 
 
 
918 aa  415  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 
918 aa  416  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.35 
 
 
918 aa  416  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.35 
 
 
918 aa  416  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.35 
 
 
918 aa  416  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.35 
 
 
918 aa  416  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  30.44 
 
 
918 aa  415  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.35 
 
 
918 aa  416  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.35 
 
 
918 aa  416  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  30 
 
 
918 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.57 
 
 
931 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  30 
 
 
918 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.89 
 
 
918 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  30 
 
 
918 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 
956 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.89 
 
 
918 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.37 
 
 
917 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.49 
 
 
929 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.08 
 
 
918 aa  405  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.02 
 
 
921 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 
917 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.4 
 
 
930 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.96 
 
 
918 aa  399  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.92 
 
 
942 aa  389  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.32 
 
 
948 aa  386  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  33.07 
 
 
942 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.61 
 
 
926 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1635  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.88 
 
 
930 aa  372  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.386153  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  28.66 
 
 
910 aa  363  1e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
1045 aa  355  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  28.42 
 
 
910 aa  353  7e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 
1363 aa  335  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 
1582 aa  335  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  38.29 
 
 
1053 aa  334  5e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
1771 aa  333  8e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  33.28 
 
 
1042 aa  333  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  32.62 
 
 
1214 aa  331  4e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1245 aa  331  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 
964 aa  331  4e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.23 
 
 
916 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
1765 aa  330  6e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 
1767 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 
1767 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  34.8 
 
 
1683 aa  322  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  32.14 
 
 
1765 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
1310 aa  322  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
1767 aa  322  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 
1397 aa  319  1e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  33.04 
 
 
1364 aa  318  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 
1040 aa  318  3e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
1240 aa  317  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  33.28 
 
 
850 aa  317  6e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 
1784 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  36.17 
 
 
1763 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
1782 aa  313  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 
835 aa  313  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  32.47 
 
 
1574 aa  312  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 
770 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 
929 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  33.03 
 
 
2035 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
1786 aa  311  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 
1792 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 
1768 aa  310  9e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 
1202 aa  310  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 
1398 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.19 
 
 
1267 aa  308  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  33.28 
 
 
765 aa  307  7e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  37.03 
 
 
1135 aa  306  1.0000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>