More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1635 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1635  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 930 aa  1863    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.386153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  39.17 
 
 		 917 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 		 922 aa  528  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  39.32 
 
 		 917 aa  525  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.19 
 
 		 916 aa  515  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  38.34 
 
 		 905 aa  508  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.63 
 
 		 919 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.34 
 
 		 917 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 		 917 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.01 
 
 		 917 aa  496  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  38.42 
 
 		 925 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  38.56 
 
 		 925 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 		 956 aa  462  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  33.89 
 
 		 942 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.44 
 
 		 922 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.55 
 
 		 927 aa  433  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  32.76 
 
 		 932 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.16 
 
 		 932 aa  432  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.12 
 
 		 906 aa  428  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  31.86 
 
 		 918 aa  422  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 918 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.75 
 
 		 918 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.75 
 
 		 918 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.75 
 
 		 918 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.28 
 
 		 931 aa  420  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.75 
 
 		 918 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.75 
 
 		 918 aa  420  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.75 
 
 		 918 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  31.86 
 
 		 918 aa  422  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.55 
 
 		 928 aa  419  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.55 
 
 		 918 aa  419  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.51 
 
 		 948 aa  416  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.97 
 
 		 918 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.97 
 
 		 918 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.08 
 
 		 918 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.08 
 
 		 918 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.08 
 
 		 918 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.38 
 
 		 918 aa  408  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.91 
 
 		 937 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.1 
 
 		 921 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.4 
 
 		 929 aa  405  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.2 
 
 		 929 aa  398  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.31 
 
 		 930 aa  399  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 936 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.51 
 
 		 941 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.22 
 
 		 933 aa  395  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.08 
 
 		 942 aa  393  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.3 
 
 		 935 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.02 
 
 		 926 aa  392  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.34 
 
 		 935 aa  388  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.6 
 
 		 950 aa  389  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.88 
 
 		 935 aa  389  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.16 
 
 		 937 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.19 
 
 		 935 aa  386  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.47 
 
 		 952 aa  383  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.01 
 
 		 933 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.09 
 
 		 933 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.34 
 
 		 932 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.09 
 
 		 933 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.56 
 
 		 933 aa  379  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  32.82 
 
 		 1042 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  29.23 
 
 		 910 aa  335  3e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  35.65 
 
 		 1014 aa  333  7.000000000000001e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.44 
 
 		 2213 aa  333  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  28.96 
 
 		 910 aa  330  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 		 1240 aa  325  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.73 
 
 		 1442 aa  317  8e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  34.62 
 
 		 1135 aa  312  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.81 
 
 		 1499 aa  312  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 929 aa  311  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 1397 aa  311  5e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 		 1788 aa  311  5e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 		 1305 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 1267 aa  307  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 		 833 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  33.05 
 
 		 1765 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 		 1548 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 		 1202 aa  305  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 1767 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  33.04 
 
 		 1287 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 		 957 aa  303  9e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 		 993 aa  303  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 		 1340 aa  302  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.42 
 
 		 1768 aa  301  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 920 aa  301  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 1310 aa  301  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 		 1771 aa  300  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 		 1193 aa  300  7e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  33.68 
 
 		 833 aa  300  7e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 1767 aa  300  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 		 1316 aa  300  8e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  38.52 
 
 		 847 aa  300  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 		 1363 aa  299  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 1767 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 1166 aa  298  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 		 1284 aa  298  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 		 1069 aa  298  4e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 		 1765 aa  297  8e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  37.07 
 
 		 1763 aa  296  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.63 
 
 		 1165 aa  296  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>