More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_37090 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  64.63 
 
 
917 aa  1038    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  64.4 
 
 
917 aa  1065    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  65.16 
 
 
917 aa  1135    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  65.6 
 
 
917 aa  1152    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  100 
 
 
905 aa  1823    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  63.78 
 
 
919 aa  1044    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  66.07 
 
 
925 aa  1088    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  65.56 
 
 
922 aa  1124    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  64.29 
 
 
917 aa  1051    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  68.5 
 
 
916 aa  1169    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  66.85 
 
 
925 aa  1104    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.32 
 
 
956 aa  628  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.82 
 
 
937 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.95 
 
 
937 aa  569  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.43 
 
 
929 aa  558  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.29 
 
 
933 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.18 
 
 
933 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.39 
 
 
932 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.18 
 
 
933 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.88 
 
 
933 aa  546  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  36.11 
 
 
932 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  38.15 
 
 
918 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.15 
 
 
918 aa  538  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.15 
 
 
918 aa  538  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.15 
 
 
918 aa  538  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.61 
 
 
927 aa  536  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.15 
 
 
918 aa  538  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.96 
 
 
933 aa  537  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.15 
 
 
918 aa  538  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.15 
 
 
918 aa  538  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  38.15 
 
 
918 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.42 
 
 
935 aa  537  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.15 
 
 
918 aa  538  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.93 
 
 
932 aa  532  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.57 
 
 
935 aa  535  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.64 
 
 
935 aa  531  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.95 
 
 
922 aa  532  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.67 
 
 
950 aa  530  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.46 
 
 
935 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.47 
 
 
918 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.47 
 
 
918 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.47 
 
 
918 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.47 
 
 
918 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.36 
 
 
918 aa  526  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.4 
 
 
918 aa  522  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.58 
 
 
952 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.99 
 
 
906 aa  518  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.78 
 
 
941 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.19 
 
 
929 aa  511  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1635  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 
930 aa  509  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.386153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.01 
 
 
931 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.15 
 
 
948 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.97 
 
 
928 aa  502  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.93 
 
 
918 aa  496  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.86 
 
 
921 aa  495  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  37.19 
 
 
942 aa  488  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.54 
 
 
930 aa  487  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.94 
 
 
942 aa  479  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 
936 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.37 
 
 
926 aa  451  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  29.91 
 
 
910 aa  396  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  29.91 
 
 
910 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  35.66 
 
 
1042 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 
1202 aa  357  5.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 
1045 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  41.78 
 
 
847 aa  354  4e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  41.65 
 
 
1346 aa  353  8e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 
1005 aa  350  7e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 
929 aa  349  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  39.41 
 
 
1014 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
1157 aa  341  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128983  unclonable  0.00000000207996 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 
1245 aa  340  7e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 
1398 aa  340  9e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  39.02 
 
 
1177 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 
1363 aa  338  3.9999999999999995e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 
770 aa  336  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 
1397 aa  335  3e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.29 
 
 
1442 aa  332  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  31.94 
 
 
923 aa  331  5.0000000000000004e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1550 aa  330  7e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  33.38 
 
 
833 aa  328  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 
833 aa  327  5e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 
1057 aa  327  6e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 
835 aa  325  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.63 
 
 
916 aa  324  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 
1768 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 
1326 aa  321  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 
1767 aa  321  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  33.23 
 
 
1574 aa  322  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 
1767 aa  321  5e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 
1040 aa  320  6e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 
1611 aa  320  7e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
1240 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 
1369 aa  320  9e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.13 
 
 
816 aa  319  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  38.39 
 
 
977 aa  320  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 
1069 aa  319  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 
964 aa  319  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 
957 aa  318  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 
1267 aa  318  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>