More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3451 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  60.66 
 
 		 918 aa  1105    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  60.66 
 
 		 918 aa  1103    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  50.37 
 
 		 932 aa  889    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.77 
 
 		 948 aa  686    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  60.66 
 
 		 918 aa  1105    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.35 
 
 		 935 aa  712    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  60.66 
 
 		 918 aa  1103    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  60.66 
 
 		 918 aa  1103    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  59.66 
 
 		 918 aa  1107    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  59.73 
 
 		 918 aa  1080    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  59.79 
 
 		 931 aa  1066    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  60.66 
 
 		 918 aa  1103    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.32 
 
 		 935 aa  710    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  59.55 
 
 		 918 aa  1106    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  97.35 
 
 		 921 aa  1849    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.55 
 
 		 932 aa  708    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.68 
 
 		 937 aa  693    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.74 
 
 		 941 aa  688    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  59.77 
 
 		 918 aa  1106    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  69.32 
 
 		 906 aa  1265    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  49.52 
 
 		 929 aa  862    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  100 
 
 		 942 aa  1927    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  59.66 
 
 		 918 aa  1106    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.75 
 
 		 950 aa  693    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.93 
 
 		 933 aa  712    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  59.37 
 
 		 922 aa  1064    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.5 
 
 		 933 aa  707    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  49.89 
 
 		 927 aa  874    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.55 
 
 		 933 aa  712    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  59.77 
 
 		 918 aa  1106    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.72 
 
 		 933 aa  709    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.65 
 
 		 933 aa  690    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.92 
 
 		 926 aa  685    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  60.66 
 
 		 918 aa  1103    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.14 
 
 		 935 aa  708    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.24 
 
 		 935 aa  711    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  60.66 
 
 		 918 aa  1103    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.98 
 
 		 952 aa  692    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.96 
 
 		 929 aa  712    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.29 
 
 		 937 aa  720    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  59.98 
 
 		 918 aa  1097    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  98.3 
 
 		 930 aa  1842    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  59.75 
 
 		 928 aa  1078    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  49.95 
 
 		 932 aa  874    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  60.66 
 
 		 918 aa  1103    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 		 956 aa  486  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  35.7 
 
 		 905 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.47 
 
 		 917 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 916 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  37.52 
 
 		 925 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  37.79 
 
 		 925 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 		 919 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  34.32 
 
 		 917 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 922 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 917 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 		 917 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 		 917 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  29.85 
 
 		 910 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  32.81 
 
 		 942 aa  398  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  29.61 
 
 		 910 aa  389  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 936 aa  389  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1635  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 		 930 aa  389  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.386153  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  32.67 
 
 		 1042 aa  343  9e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 		 1045 aa  337  7e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 816 aa  325  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  31.91 
 
 		 1135 aa  323  7e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 		 1611 aa  318  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.59 
 
 		 1442 aa  317  6e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 1326 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 1582 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  30.57 
 
 		 1014 aa  313  6.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  31.39 
 
 		 1763 aa  313  9e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 1771 aa  312  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  35.14 
 
 		 852 aa  311  4e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 		 1767 aa  311  5e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.44 
 
 		 1767 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 1767 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  29.67 
 
 		 1765 aa  308  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 		 964 aa  306  9.000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  33.07 
 
 		 923 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.28 
 
 		 1331 aa  305  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 1266 aa  304  5.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  31.79 
 
 		 1574 aa  302  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 		 1784 aa  301  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 		 1240 aa  301  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.58 
 
 		 2213 aa  301  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 		 1622 aa  300  7e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.25 
 
 		 1786 aa  300  7e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 		 1782 aa  300  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.54 
 
 		 1165 aa  298  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 		 929 aa  297  5e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 1768 aa  297  6e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 916 aa  296  9e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 		 833 aa  296  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  35.89 
 
 		 2035 aa  296  1e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 		 1166 aa  295  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 1267 aa  294  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.94 
 
 		 1792 aa  294  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 		 920 aa  294  6e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 		 1363 aa  294  6e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>