More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1191 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  42.83 
 
 		 918 aa  696    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.72 
 
 		 918 aa  694    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  62.39 
 
 		 937 aa  1176    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  42.83 
 
 		 918 aa  696    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.32 
 
 		 948 aa  704    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.8 
 
 		 906 aa  734    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  68.14 
 
 		 935 aa  1309    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  63.81 
 
 		 937 aa  1219    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.31 
 
 		 918 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  68.42 
 
 		 932 aa  1312    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.72 
 
 		 918 aa  694    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.72 
 
 		 918 aa  694    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.72 
 
 		 918 aa  694    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.55 
 
 		 942 aa  682    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  62.55 
 
 		 933 aa  1170    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  68.1 
 
 		 935 aa  1311    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  68.42 
 
 		 933 aa  1319    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.01 
 
 		 921 aa  701    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  63.45 
 
 		 929 aa  1212    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  100 
 
 		 950 aa  1949    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.72 
 
 		 918 aa  694    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.69 
 
 		 928 aa  696    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.26 
 
 		 918 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.72 
 
 		 918 aa  694    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.18 
 
 		 930 aa  691    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  68.95 
 
 		 935 aa  1319    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  68.84 
 
 		 935 aa  1318    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  68.32 
 
 		 933 aa  1318    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  70.69 
 
 		 952 aa  1374    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  67.72 
 
 		 933 aa  1307    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  68.21 
 
 		 933 aa  1318    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.63 
 
 		 927 aa  736    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.91 
 
 		 926 aa  654    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.2 
 
 		 918 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.31 
 
 		 918 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  40.98 
 
 		 922 aa  682    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.15 
 
 		 932 aa  779    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.36 
 
 		 929 aa  739    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.31 
 
 		 918 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.53 
 
 		 918 aa  690    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  63.19 
 
 		 941 aa  1208    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  44.21 
 
 		 932 aa  778    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.72 
 
 		 918 aa  694    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  41.15 
 
 		 918 aa  684    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.15 
 
 		 917 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.85 
 
 		 919 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.43 
 
 		 916 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  40.13 
 
 		 925 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  40.28 
 
 		 925 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  36.72 
 
 		 917 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  36.6 
 
 		 905 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 		 922 aa  522  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 		 917 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.77 
 
 		 917 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  48.32 
 
 		 931 aa  508  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 917 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.99 
 
 		 956 aa  495  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  34.7 
 
 		 942 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  31.32 
 
 		 910 aa  420  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  31.5 
 
 		 910 aa  418  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 		 936 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.22 
 
 		 1045 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  38.21 
 
 		 1042 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1635  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 		 930 aa  376  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.386153  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 		 1611 aa  339  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  32.49 
 
 		 1683 aa  335  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 1240 aa  333  6e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 		 1326 aa  333  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  34.44 
 
 		 2035 aa  332  2e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 		 929 aa  331  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 		 1069 aa  331  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 		 1369 aa  327  8.000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 		 1284 aa  325  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.45 
 
 		 636 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 		 1267 aa  325  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  31.4 
 
 		 923 aa  324  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 		 758 aa  324  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.59 
 
 		 1331 aa  321  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 		 1771 aa  319  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 		 835 aa  318  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 816 aa  318  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.86 
 
 		 1005 aa  318  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  34 
 
 		 2213 aa  318  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 1363 aa  318  4e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  36.07 
 
 		 1135 aa  318  4e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 		 1622 aa  317  5e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  30.63 
 
 		 1014 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 		 920 aa  316  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.13 
 
 		 1245 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  35.48 
 
 		 1765 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 		 649 aa  315  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 1340 aa  315  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 		 1310 aa  314  4.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 		 921 aa  313  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1333 aa  313  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 		 1788 aa  313  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 1166 aa  312  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0347  putative signal transduction histidine kinase sensor  33.28 
 
 		 1135 aa  312  2e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  37.77 
 
 		 1346 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  36.15 
 
 		 977 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>