More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0507 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  51.41 
 
 		 1042 aa  1080    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1045 aa  2165    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.59 
 
 		 933 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.93 
 
 		 929 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.67 
 
 		 937 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.68 
 
 		 933 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.68 
 
 		 933 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.71 
 
 		 935 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.52 
 
 		 933 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.68 
 
 		 932 aa  403  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.4 
 
 		 935 aa  398  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.59 
 
 		 950 aa  396  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.34 
 
 		 937 aa  399  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.34 
 
 		 935 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.07 
 
 		 952 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.46 
 
 		 906 aa  396  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.17 
 
 		 933 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.17 
 
 		 941 aa  392  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.87 
 
 		 935 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  37.65 
 
 		 932 aa  389  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.61 
 
 		 932 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.89 
 
 		 918 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.75 
 
 		 918 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.89 
 
 		 918 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.75 
 
 		 918 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.29 
 
 		 918 aa  376  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  34.3 
 
 		 918 aa  376  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 		 918 aa  376  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.48 
 
 		 948 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.29 
 
 		 918 aa  376  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.29 
 
 		 918 aa  376  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.65 
 
 		 927 aa  375  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  34.3 
 
 		 918 aa  376  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.75 
 
 		 918 aa  376  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.29 
 
 		 918 aa  376  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.29 
 
 		 918 aa  376  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.29 
 
 		 918 aa  376  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.01 
 
 		 929 aa  373  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.52 
 
 		 918 aa  372  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.46 
 
 		 931 aa  364  4e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 956 aa  362  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  32.74 
 
 		 942 aa  360  7e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 916 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.01 
 
 		 928 aa  357  8.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  34.49 
 
 		 905 aa  356  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.18 
 
 		 918 aa  355  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 		 936 aa  355  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 		 922 aa  354  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.24 
 
 		 921 aa  350  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.48 
 
 		 930 aa  343  7e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  34.38 
 
 		 925 aa  343  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.78 
 
 		 926 aa  343  1e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  33.68 
 
 		 925 aa  340  7e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 917 aa  338  5e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 		 917 aa  337  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.75 
 
 		 942 aa  335  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 		 917 aa  334  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  31.57 
 
 		 910 aa  305  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  31.27 
 
 		 910 aa  298  3e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  31.67 
 
 		 1214 aa  296  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 		 1033 aa  292  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 		 1326 aa  291  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 929 aa  291  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 		 1582 aa  290  7e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.8 
 
 		 1260 aa  290  7e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 		 1245 aa  290  9e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 1788 aa  290  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  30.65 
 
 		 1683 aa  288  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  30.99 
 
 		 1014 aa  288  5e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.4 
 
 		 914 aa  287  5.999999999999999e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 		 1005 aa  283  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 		 916 aa  282  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 		 1305 aa  282  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1635  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 930 aa  281  4e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.386153  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 		 1767 aa  280  7e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 1266 aa  279  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2105  PAS  31.91 
 
 		 680 aa  279  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 816 aa  279  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 		 1767 aa  279  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.64 
 
 		 2213 aa  278  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.82 
 
 		 1331 aa  278  5e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  31.91 
 
 		 923 aa  278  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  32.16 
 
 		 1287 aa  277  7e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  30.86 
 
 		 1763 aa  277  9e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 		 927 aa  276  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 		 1768 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.44 
 
 		 1333 aa  276  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 1316 aa  276  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.7 
 
 		 1442 aa  276  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 		 1765 aa  275  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 		 909 aa  275  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.76 
 
 		 1303 aa  274  7e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 		 1193 aa  274  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  31.85 
 
 		 833 aa  274  8.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 957 aa  274  8.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 		 1397 aa  273  9e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.86 
 
 		 1233 aa  273  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 1784 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.59 
 
 		 1053 aa  272  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 		 1340 aa  271  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>