More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0926 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  99.89 
 
 
918 aa  1881    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
918 aa  1883    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.56 
 
 
948 aa  705    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  100 
 
 
918 aa  1883    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  52.42 
 
 
932 aa  922    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.72 
 
 
935 aa  743    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.6 
 
 
933 aa  747    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.6 
 
 
933 aa  746    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  60.99 
 
 
922 aa  1084    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  90.34 
 
 
918 aa  1691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.27 
 
 
926 aa  703    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  52.52 
 
 
932 aa  920    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  90.12 
 
 
918 aa  1687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  100 
 
 
918 aa  1883    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.39 
 
 
937 aa  725    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  62.01 
 
 
918 aa  1095    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.71 
 
 
933 aa  749    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  99.89 
 
 
918 aa  1881    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  60.32 
 
 
942 aa  1108    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  90.45 
 
 
918 aa  1692    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  100 
 
 
918 aa  1883    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.6 
 
 
932 aa  743    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.83 
 
 
935 aa  738    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  100 
 
 
918 aa  1883    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  66.25 
 
 
906 aa  1183    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  61.92 
 
 
921 aa  1129    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.05 
 
 
950 aa  716    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.09 
 
 
933 aa  744    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.25 
 
 
941 aa  721    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  90.34 
 
 
918 aa  1690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  90.12 
 
 
918 aa  1688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.71 
 
 
933 aa  734    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  53.56 
 
 
927 aa  932    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.52 
 
 
935 aa  736    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.52 
 
 
935 aa  739    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.9 
 
 
952 aa  727    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  61.27 
 
 
928 aa  1078    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  61.51 
 
 
931 aa  1072    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  100 
 
 
918 aa  1883    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  50.59 
 
 
929 aa  889    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.04 
 
 
929 aa  749    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  85.4 
 
 
918 aa  1592    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.71 
 
 
937 aa  723    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  100 
 
 
918 aa  1883    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  61.21 
 
 
930 aa  1118    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.34 
 
 
917 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  38.19 
 
 
925 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  38.13 
 
 
925 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  37.86 
 
 
905 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.06 
 
 
916 aa  525  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.25 
 
 
917 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  37.33 
 
 
917 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.99 
 
 
922 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.89 
 
 
919 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 
917 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 
917 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
956 aa  497  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 
936 aa  409  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  29.14 
 
 
910 aa  403  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1635  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 
930 aa  398  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.386153  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  29.51 
 
 
910 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  34.76 
 
 
1042 aa  385  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
1045 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 
1326 aa  354  5e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 
1069 aa  345  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.44 
 
 
1331 aa  343  7e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
1369 aa  342  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  34.24 
 
 
1763 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
929 aa  337  5e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  33.99 
 
 
923 aa  336  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 
816 aa  335  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
1245 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  35.91 
 
 
852 aa  332  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.69 
 
 
1442 aa  332  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
920 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 
916 aa  329  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 
1765 aa  328  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 
1202 aa  326  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
1768 aa  326  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  31.74 
 
 
1014 aa  325  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 
1165 aa  325  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
1767 aa  324  5e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
1611 aa  323  7e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  38.14 
 
 
1177 aa  323  8e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  33.08 
 
 
1765 aa  323  8e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 
1767 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  33.14 
 
 
1135 aa  322  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
1166 aa  322  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 
1771 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.8 
 
 
2213 aa  322  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  35.23 
 
 
1297 aa  320  7.999999999999999e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
1267 aa  319  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 
1548 aa  318  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 
833 aa  316  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
1767 aa  316  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 
1398 aa  314  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 
1582 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.09 
 
 
909 aa  313  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 
1033 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 
964 aa  311  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>