More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3291 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  44.49 
 
 		 918 aa  722    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.49 
 
 		 918 aa  721    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.37 
 
 		 948 aa  715    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.82 
 
 		 928 aa  711    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  70.43 
 
 		 937 aa  1318    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.42 
 
 		 918 aa  718    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  90.8 
 
 		 935 aa  1754    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.93 
 
 		 918 aa  706    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  46.04 
 
 		 932 aa  803    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.42 
 
 		 918 aa  718    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.49 
 
 		 918 aa  721    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.42 
 
 		 918 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  67.16 
 
 		 937 aa  1251    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.05 
 
 		 927 aa  767    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  99.36 
 
 		 933 aa  1905    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  100 
 
 		 933 aa  1913    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.17 
 
 		 930 aa  705    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.49 
 
 		 918 aa  721    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.3 
 
 		 929 aa  769    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.49 
 
 		 918 aa  721    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  44.49 
 
 		 918 aa  722    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  99.36 
 
 		 933 aa  1903    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  68.21 
 
 		 950 aa  1313    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.86 
 
 		 932 aa  801    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.51 
 
 		 942 aa  697    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  68.5 
 
 		 941 aa  1283    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.84 
 
 		 918 aa  704    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.46 
 
 		 926 aa  686    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  91.12 
 
 		 935 aa  1759    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  91.12 
 
 		 935 aa  1764    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.42 
 
 		 918 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  47.54 
 
 		 906 aa  763    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.53 
 
 		 918 aa  718    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  69.01 
 
 		 952 aa  1350    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  99.25 
 
 		 932 aa  1898    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  68.7 
 
 		 929 aa  1290    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  91.12 
 
 		 935 aa  1758    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  66.45 
 
 		 933 aa  1244    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.49 
 
 		 918 aa  721    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  91.75 
 
 		 933 aa  1778    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.49 
 
 		 918 aa  721    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.23 
 
 		 922 aa  697    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.03 
 
 		 921 aa  712    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  44.49 
 
 		 918 aa  721    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.49 
 
 		 917 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  37.16 
 
 		 917 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  38.18 
 
 		 905 aa  534  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  50 
 
 		 931 aa  529  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  38.11 
 
 		 925 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 922 aa  529  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 917 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 		 919 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  38.06 
 
 		 925 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 		 916 aa  522  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 		 917 aa  512  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.75 
 
 		 917 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 		 956 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  34.5 
 
 		 942 aa  428  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.92 
 
 		 936 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.52 
 
 		 1045 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  35.42 
 
 		 1042 aa  392  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  30.11 
 
 		 910 aa  389  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  30 
 
 		 910 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1635  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 930 aa  366  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.386153  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 		 1611 aa  342  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  31.46 
 
 		 1014 aa  334  4e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 		 1326 aa  333  9e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 		 1157 aa  327  6e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128983  unclonable  0.00000000207996 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 		 929 aa  326  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0381  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 		 1169 aa  325  2e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210109 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0347  putative signal transduction histidine kinase sensor  34.38 
 
 		 1135 aa  325  4e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 		 758 aa  323  9.000000000000001e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  32.55 
 
 		 923 aa  321  3.9999999999999996e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 		 1622 aa  319  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 		 1240 aa  318  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 1303 aa  317  5e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 		 1069 aa  317  7e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 816 aa  317  8e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  35.25 
 
 		 1177 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  34 
 
 		 1214 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 		 1369 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.22 
 
 		 2213 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  36.13 
 
 		 1135 aa  315  2.9999999999999996e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 		 921 aa  314  3.9999999999999997e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 		 1284 aa  313  9e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  37.59 
 
 		 1346 aa  313  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.79 
 
 		 1331 aa  312  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.69 
 
 		 1550 aa  312  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1340 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  37.73 
 
 		 847 aa  310  8e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  32.54 
 
 		 750 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 		 1548 aa  308  3e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 		 812 aa  307  6e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 		 1267 aa  305  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 1193 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 		 1245 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 835 aa  305  4.0000000000000003e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1202 aa  304  5.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  33.38 
 
 		 852 aa  304  6.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 1033 aa  302  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>