More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0347 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0347  putative signal transduction histidine kinase sensor  100 
 
 
1135 aa  2334    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0381  multi-sensor hybrid histidine kinase  91.19 
 
 
1169 aa  2147    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0210109 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.78 
 
 
1157 aa  966    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128983  unclonable  0.00000000207996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.29 
 
 
919 aa  337  7e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.88 
 
 
932 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
917 aa  331  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.84 
 
 
933 aa  331  6e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.8 
 
 
933 aa  330  8e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.8 
 
 
933 aa  330  9e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.29 
 
 
917 aa  330  9e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.6 
 
 
933 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 
916 aa  327  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  33.2 
 
 
917 aa  326  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 
917 aa  326  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.67 
 
 
935 aa  325  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  31.88 
 
 
917 aa  325  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.54 
 
 
935 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.29 
 
 
935 aa  322  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.87 
 
 
935 aa  321  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.59 
 
 
929 aa  318  3e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.39 
 
 
906 aa  317  7e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.03 
 
 
932 aa  313  9e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.93 
 
 
937 aa  313  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.49 
 
 
952 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  31.85 
 
 
932 aa  311  5.9999999999999995e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.35 
 
 
950 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.85 
 
 
933 aa  302  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.38 
 
 
918 aa  298  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.02 
 
 
922 aa  297  6e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.42 
 
 
927 aa  293  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.98 
 
 
921 aa  290  8e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.36 
 
 
930 aa  287  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.37 
 
 
937 aa  287  7e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.24 
 
 
942 aa  283  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  34.07 
 
 
925 aa  283  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 
918 aa  281  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.15 
 
 
918 aa  281  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.15 
 
 
918 aa  281  5e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.15 
 
 
918 aa  281  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.15 
 
 
918 aa  281  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.15 
 
 
918 aa  281  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.15 
 
 
918 aa  281  5e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.9 
 
 
948 aa  280  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.35 
 
 
926 aa  278  5e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  41.96 
 
 
925 aa  273  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
1245 aa  273  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1635  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 
930 aa  271  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.386153  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 
922 aa  271  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.62 
 
 
1499 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  32.13 
 
 
923 aa  264  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 
956 aa  264  6.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 
1202 aa  264  6.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.21 
 
 
929 aa  261  7e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 
1057 aa  259  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 
1310 aa  259  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.47 
 
 
918 aa  257  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  44.55 
 
 
905 aa  254  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 
1326 aa  254  6e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.06 
 
 
918 aa  253  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.86 
 
 
918 aa  253  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.86 
 
 
918 aa  253  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 
921 aa  252  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.06 
 
 
918 aa  253  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.86 
 
 
918 aa  253  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
1611 aa  252  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 
1267 aa  252  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 
1165 aa  252  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 
876 aa  251  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  38.96 
 
 
910 aa  249  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
1765 aa  249  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 
1266 aa  248  6e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 
1767 aa  248  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
1305 aa  247  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  31.33 
 
 
1135 aa  246  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  34.74 
 
 
918 aa  245  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 
1550 aa  245  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  34.74 
 
 
918 aa  245  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 
1193 aa  245  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  30.95 
 
 
1214 aa  245  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  38.42 
 
 
910 aa  243  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 
993 aa  243  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 
981 aa  241  8e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.49 
 
 
928 aa  240  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2104  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 
1042 aa  239  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  31.27 
 
 
1364 aa  240  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  42.81 
 
 
931 aa  239  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  28.73 
 
 
1179 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3839  histidine kinase  31.25 
 
 
590 aa  239  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 
1314 aa  238  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.23 
 
 
941 aa  238  4e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  31.92 
 
 
1055 aa  237  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 
738 aa  236  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 
1101 aa  236  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 
927 aa  236  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 
909 aa  234  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
991 aa  233  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  31.43 
 
 
942 aa  232  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
899 aa  232  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2502  sensor histidine kinase/response regulator  28.62 
 
 
676 aa  231  6e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000989132  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.6 
 
 
1069 aa  231  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>