More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2520 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  50.88 
 
 		 918 aa  874    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  50.88 
 
 		 918 aa  874    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.58 
 
 		 929 aa  786    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.36 
 
 		 948 aa  755    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.13 
 
 		 935 aa  784    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.38 
 
 		 933 aa  776    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  46.55 
 
 		 926 aa  774    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.55 
 
 		 935 aa  788    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  51.32 
 
 		 918 aa  879    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  50.27 
 
 		 928 aa  866    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  49.42 
 
 		 942 aa  851    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  50.88 
 
 		 918 aa  874    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  50.88 
 
 		 918 aa  874    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  51.43 
 
 		 918 aa  880    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  51.43 
 
 		 918 aa  880    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.51 
 
 		 933 aa  783    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  67.66 
 
 		 932 aa  1295    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.51 
 
 		 932 aa  779    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  50.88 
 
 		 918 aa  874    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.1 
 
 		 950 aa  746    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  50.7 
 
 		 918 aa  873    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.3 
 
 		 933 aa  781    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  50.88 
 
 		 918 aa  874    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.27 
 
 		 937 aa  778    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.7 
 
 		 933 aa  786    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  51.18 
 
 		 918 aa  881    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.45 
 
 		 937 aa  780    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  66.45 
 
 		 927 aa  1252    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  50.43 
 
 		 921 aa  868    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.13 
 
 		 935 aa  779    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.56 
 
 		 935 aa  789    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  50.88 
 
 		 918 aa  874    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  43.65 
 
 		 952 aa  771    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  51.43 
 
 		 918 aa  880    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  54.02 
 
 		 906 aa  916    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  50.88 
 
 		 918 aa  874    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  51.32 
 
 		 918 aa  879    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.51 
 
 		 933 aa  781    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  51.18 
 
 		 922 aa  886    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  45.35 
 
 		 941 aa  758    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  50.95 
 
 		 931 aa  857    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  67.27 
 
 		 932 aa  1290    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  50 
 
 		 930 aa  861    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  100 
 
 		 929 aa  1902    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  50.88 
 
 		 918 aa  874    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  35.43 
 
 		 917 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 922 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  35.79 
 
 		 917 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 		 917 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 		 916 aa  530  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  35.94 
 
 		 925 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  35.65 
 
 		 925 aa  516  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 917 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 		 917 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  35.86 
 
 		 905 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 		 919 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 956 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  34.84 
 
 		 942 aa  419  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  39.03 
 
 		 1042 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 		 936 aa  405  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1635  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 		 930 aa  392  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.386153  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  29.51 
 
 		 910 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  29.24 
 
 		 910 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 		 1045 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 929 aa  369  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 816 aa  357  5.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 		 1326 aa  353  8e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.43 
 
 		 2213 aa  348  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 		 1771 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  31.65 
 
 		 1014 aa  344  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.29 
 
 		 1245 aa  343  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 		 1767 aa  342  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  35.04 
 
 		 1763 aa  342  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 1767 aa  341  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 1767 aa  341  4e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 		 1165 aa  340  8e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 		 1765 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1792 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 		 1782 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  35.99 
 
 		 1765 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 		 1768 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 1784 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 		 1397 aa  336  1e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.89 
 
 		 1331 aa  335  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 		 977 aa  334  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 812 aa  334  4e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 1245 aa  334  5e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  38.57 
 
 		 1177 aa  332  1e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 1786 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 1611 aa  332  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  35.16 
 
 		 852 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 1582 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  32.86 
 
 		 1683 aa  328  3e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 		 1266 aa  328  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 1398 aa  328  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 		 1040 aa  327  5e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  34.67 
 
 		 1346 aa  327  9e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  36.55 
 
 		 1135 aa  325  3e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 1033 aa  325  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 1305 aa  325  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>