More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00490 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  100 
 
 		 1042 aa  2152    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.21 
 
 		 1045 aa  1080    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.87 
 
 		 933 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.56 
 
 		 937 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.16 
 
 		 929 aa  412  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  39.17 
 
 		 929 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.69 
 
 		 906 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.19 
 
 		 927 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.66 
 
 		 918 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.32 
 
 		 932 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  37.61 
 
 		 932 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  38.1 
 
 		 941 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.48 
 
 		 948 aa  398  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.46 
 
 		 918 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.46 
 
 		 918 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.85 
 
 		 950 aa  399  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.46 
 
 		 918 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.46 
 
 		 918 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.32 
 
 		 918 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.09 
 
 		 952 aa  395  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.33 
 
 		 937 aa  395  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.92 
 
 		 933 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.35 
 
 		 933 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.36 
 
 		 935 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.46 
 
 		 922 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.93 
 
 		 918 aa  392  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.92 
 
 		 933 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.35 
 
 		 932 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.35 
 
 		 933 aa  392  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.35 
 
 		 935 aa  389  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.61 
 
 		 931 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.83 
 
 		 928 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.12 
 
 		 935 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.27 
 
 		 935 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  34.95 
 
 		 918 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 918 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.95 
 
 		 918 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.95 
 
 		 918 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.95 
 
 		 918 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.95 
 
 		 918 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.95 
 
 		 918 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.95 
 
 		 918 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  34.95 
 
 		 918 aa  381  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 		 922 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 		 956 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 		 919 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  36.59 
 
 		 917 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.38 
 
 		 917 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  35.66 
 
 		 905 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 		 917 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 		 917 aa  366  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 		 916 aa  366  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  36.06 
 
 		 925 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 		 917 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.82 
 
 		 921 aa  355  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  35.61 
 
 		 925 aa  352  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.38 
 
 		 930 aa  351  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.65 
 
 		 926 aa  350  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  32.17 
 
 		 942 aa  345  4e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.67 
 
 		 942 aa  343  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 		 936 aa  333  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1635  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 930 aa  327  6e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.386153  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  32.19 
 
 		 910 aa  322  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  32.23 
 
 		 910 aa  319  2e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 		 1767 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 1767 aa  299  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 		 1767 aa  298  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 929 aa  290  9e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  31.51 
 
 		 1765 aa  289  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 		 1611 aa  289  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 		 1771 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  34.51 
 
 		 833 aa  285  4.0000000000000003e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  35.33 
 
 		 1763 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.51 
 
 		 909 aa  284  7.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 1333 aa  282  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00899  sensory box histidine kinase/response regulator  32.5 
 
 		 1070 aa  280  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 1768 aa  279  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 		 916 aa  278  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 		 1765 aa  277  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  31.06 
 
 		 1683 aa  277  9e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 		 1313 aa  277  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 1692 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 		 925 aa  275  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.39 
 
 		 858 aa  275  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.12 
 
 		 1326 aa  275  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 		 1305 aa  274  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 1782 aa  274  6e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  33.01 
 
 		 1287 aa  274  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1284 aa  273  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.64 
 
 		 1033 aa  273  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 		 912 aa  273  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.78 
 
 		 950 aa  273  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  32.16 
 
 		 1364 aa  272  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.03 
 
 		 1442 aa  271  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.1 
 
 		 1053 aa  270  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 		 1426 aa  270  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  34.16 
 
 		 1135 aa  270  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.38 
 
 		 2213 aa  270  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 		 778 aa  270  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.46 
 
 		 914 aa  269  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>