More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1949 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  100 
 
 
833 aa  1711    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 
977 aa  412  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 
817 aa  389  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.64 
 
 
923 aa  379  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 
921 aa  375  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  39.97 
 
 
1346 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.13 
 
 
909 aa  362  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  31.99 
 
 
925 aa  353  8e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 
1397 aa  351  3e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  39.43 
 
 
1014 aa  349  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 
916 aa  348  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 
1310 aa  346  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.31 
 
 
818 aa  346  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 
1069 aa  345  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 
1398 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  31.24 
 
 
925 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  31.44 
 
 
917 aa  342  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 
1369 aa  342  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.26 
 
 
1363 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.2 
 
 
818 aa  340  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  31.74 
 
 
917 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 
1284 aa  339  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  37.24 
 
 
793 aa  337  7.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.24 
 
 
1442 aa  336  7.999999999999999e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  39.7 
 
 
1135 aa  335  2e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.81 
 
 
1768 aa  335  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  34.32 
 
 
785 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.95 
 
 
916 aa  334  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  35.98 
 
 
785 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 
1240 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 
917 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 
812 aa  331  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 
1767 aa  331  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  39.55 
 
 
1177 aa  331  4e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.29 
 
 
796 aa  331  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 
1767 aa  330  4e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.41 
 
 
932 aa  330  5.0000000000000004e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 
919 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  38.77 
 
 
758 aa  330  7e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  36.1 
 
 
2035 aa  330  8e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.23 
 
 
1331 aa  330  8e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 
956 aa  330  9e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 
1118 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  38.41 
 
 
1407 aa  328  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 
917 aa  328  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 
1040 aa  328  3e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  33.33 
 
 
785 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  35.12 
 
 
785 aa  327  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  30.54 
 
 
932 aa  327  6e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 
922 aa  326  9e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 
1266 aa  325  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 
833 aa  325  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
1166 aa  325  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 
1767 aa  324  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 
1240 aa  323  7e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  34.63 
 
 
905 aa  323  8e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  36.46 
 
 
1765 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
917 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 
1550 aa  323  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  38.12 
 
 
1763 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.27 
 
 
918 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.18 
 
 
1499 aa  321  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.41 
 
 
816 aa  320  7e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1765 aa  320  9e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.06 
 
 
2213 aa  320  9e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5358  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 
891 aa  319  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.102832 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.77 
 
 
929 aa  319  1e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 
991 aa  319  1e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.67 
 
 
927 aa  319  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2502  sensor histidine kinase/response regulator  34 
 
 
676 aa  317  5e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000989132  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  37.03 
 
 
852 aa  316  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 
1267 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 
1234 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 
920 aa  315  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.7 
 
 
937 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  38.88 
 
 
1188 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
1326 aa  314  4.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 
1238 aa  314  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 
1238 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 
1771 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 
1238 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 
682 aa  313  6.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  34.77 
 
 
786 aa  313  9e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 
1236 aa  313  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 
1238 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 
1340 aa  311  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.88 
 
 
1236 aa  311  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.88 
 
 
1236 aa  311  4e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.88 
 
 
1236 aa  311  5e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 
1230 aa  310  5e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  38.13 
 
 
977 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 
928 aa  310  6.999999999999999e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3895  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
920 aa  310  9e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.750763  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 
705 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.45 
 
 
922 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 
981 aa  308  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  34.64 
 
 
1574 aa  307  5.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1911  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 
787 aa  307  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0413731  normal  0.503462 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 
1788 aa  307  7e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 
946 aa  306  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>