More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2502 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2502  sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 		 676 aa  1390    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000989132  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  36.87 
 
 		 2035 aa  353  4e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.52 
 
 		 929 aa  350  6e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 916 aa  348  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 812 aa  343  9e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 		 1788 aa  339  9e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 1397 aa  336  1e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 		 1548 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  35.26 
 
 		 1177 aa  334  4e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 		 1202 aa  333  7.000000000000001e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 1611 aa  331  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  35.45 
 
 		 1030 aa  330  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 		 1550 aa  330  7e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 		 1622 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 1326 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.59 
 
 		 1442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 		 1398 aa  328  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  34.58 
 
 		 847 aa  325  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  35.83 
 
 		 852 aa  324  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 		 1284 aa  324  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.72 
 
 		 2213 aa  323  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  31.51 
 
 		 977 aa  323  8e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 1245 aa  323  8e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  34.96 
 
 		 1346 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 		 1040 aa  322  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  33.44 
 
 		 1765 aa  321  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 		 920 aa  321  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 		 1118 aa  321  3e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  35.41 
 
 		 1135 aa  318  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  34 
 
 		 833 aa  317  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 1165 aa  317  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 		 816 aa  315  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2105  PAS  34.45 
 
 		 680 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1369 aa  313  9e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  36.69 
 
 		 1179 aa  312  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 833 aa  312  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 		 1767 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 		 1767 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  33.75 
 
 		 1014 aa  310  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 1069 aa  311  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 835 aa  309  9e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 		 1582 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 		 921 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  34.81 
 
 		 1683 aa  308  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 1255 aa  307  5.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 		 1603 aa  307  5.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 		 1767 aa  306  6e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 		 1771 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  32.58 
 
 		 1763 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 1267 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 		 946 aa  305  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 1333 aa  304  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  35.23 
 
 		 1407 aa  303  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 1238 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 1303 aa  303  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 		 1310 aa  303  6.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 		 1238 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 		 1238 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 1768 aa  302  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 		 1765 aa  302  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 		 1236 aa  302  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 		 1203 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 		 1782 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 977 aa  302  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 1340 aa  302  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 1784 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 1238 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 		 1245 aa  300  7e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 		 1363 aa  299  9e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 1287 aa  300  9e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 1240 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 		 1792 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 1234 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  34.48 
 
 		 1188 aa  298  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  34.62 
 
 		 1200 aa  297  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 		 1786 aa  297  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 		 1236 aa  297  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 		 1236 aa  297  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 		 1128 aa  297  4e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 		 1236 aa  297  5e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.48 
 
 		 1499 aa  296  6e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.3 
 
 		 1016 aa  296  8e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 705 aa  296  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 		 758 aa  295  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1230 aa  295  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 		 1240 aa  294  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.58 
 
 		 858 aa  294  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  33.52 
 
 		 750 aa  294  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.28 
 
 		 2654 aa  293  5e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 		 912 aa  293  6e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  32.16 
 
 		 1574 aa  293  7e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 		 1193 aa  293  8e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 957 aa  293  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 		 1266 aa  293  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 		 1005 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.93 
 
 		 1331 aa  291  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  30.78 
 
 		 923 aa  290  7e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  32.08 
 
 		 1364 aa  290  8e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 		 1245 aa  288  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 		 1643 aa  288  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>