More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5358 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3817  Hpt sensor hybrid histidine kinase  59.73 
 
 
909 aa  805    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3510  ATPase domain-containing protein  59.75 
 
 
932 aa  830    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5358  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
891 aa  1699    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.102832 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3895  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.83 
 
 
920 aa  811    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.750763  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2086  multi-sensor hybrid histidine kinase  58.87 
 
 
909 aa  767    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 
921 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  39.18 
 
 
923 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
909 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  35.37 
 
 
833 aa  355  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 
977 aa  352  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
818 aa  340  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 
1765 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  35.22 
 
 
1014 aa  326  9e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 
1005 aa  319  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 
1266 aa  319  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 
1069 aa  318  4e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 
816 aa  317  9e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
1771 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.65 
 
 
1331 aa  316  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 
1767 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 
899 aa  315  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 
1245 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 
1767 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1767 aa  313  9e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 
1768 aa  313  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
1310 aa  311  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 
1369 aa  311  5e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  37.03 
 
 
1765 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  30.03 
 
 
910 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 
1202 aa  308  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 
1267 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 
1611 aa  308  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  38.07 
 
 
1177 aa  308  4.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.61 
 
 
738 aa  306  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 
1009 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.53 
 
 
933 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  38.45 
 
 
850 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 
946 aa  305  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 
993 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.8 
 
 
937 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
929 aa  305  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  29.34 
 
 
910 aa  304  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  38.32 
 
 
750 aa  304  6.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
1622 aa  302  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  38.3 
 
 
1322 aa  301  4e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.87 
 
 
1165 aa  299  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  34.66 
 
 
1135 aa  298  3e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1582 aa  298  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  35.14 
 
 
917 aa  296  8e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 
916 aa  296  8e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
1498 aa  296  8e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
1326 aa  295  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.09 
 
 
2213 aa  294  5e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 
1303 aa  294  5e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.81 
 
 
1363 aa  294  6e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  40.03 
 
 
758 aa  293  8e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.31 
 
 
917 aa  293  9e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.29 
 
 
929 aa  293  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  40.92 
 
 
918 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  32.67 
 
 
891 aa  292  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.5 
 
 
927 aa  292  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 
922 aa  291  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 
1260 aa  291  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  38.88 
 
 
847 aa  291  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  34.1 
 
 
1001 aa  291  5.0000000000000004e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.03 
 
 
935 aa  290  8e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 
964 aa  290  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.64 
 
 
935 aa  289  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 
917 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.41 
 
 
833 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 
916 aa  288  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.2 
 
 
935 aa  288  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.76 
 
 
796 aa  287  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  34.09 
 
 
765 aa  288  5e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.8 
 
 
1258 aa  287  5.999999999999999e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1782  sensor histidine kinase/response regulator  34.74 
 
 
783 aa  287  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  33.23 
 
 
1407 aa  286  8e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000544  hypothetical protein  31.83 
 
 
828 aa  286  9e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.85 
 
 
937 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.71 
 
 
933 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.44 
 
 
782 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.29 
 
 
1820 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
817 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 
957 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.55 
 
 
919 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
1398 aa  286  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  35.26 
 
 
925 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 
784 aa  285  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
1072 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.4 
 
 
932 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
917 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
990 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.38 
 
 
935 aa  285  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3344  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
1390 aa  285  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0298  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
899 aa  284  6.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0542846  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  40.29 
 
 
918 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.68 
 
 
933 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.73 
 
 
933 aa  283  9e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0305  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
967 aa  283  1e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  unclonable  0.00000133293 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 
991 aa  282  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>