More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00475 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  100 
 
 		 1364 aa  2771    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 		 1374 aa  644    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  37.96 
 
 		 1353 aa  628  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 		 1158 aa  562  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  41.13 
 
 		 1287 aa  500  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 		 1560 aa  478  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.58 
 
 		 2213 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  35.07 
 
 		 1763 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 1765 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  37.66 
 
 		 1765 aa  431  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 1767 aa  432  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 		 1767 aa  432  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.04 
 
 		 1603 aa  429  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 		 1768 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 1767 aa  425  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 		 1771 aa  426  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 903 aa  416  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 		 1165 aa  412  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 1786 aa  412  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.06 
 
 		 1331 aa  411  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 		 1782 aa  413  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 		 1792 aa  410  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.37 
 
 		 1340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 1203 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 		 1784 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  36.36 
 
 		 1439 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 1548 aa  405  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 1326 aa  403  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 1245 aa  402  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 		 2654 aa  403  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 1128 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 		 1582 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  32.89 
 
 		 1626 aa  398  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 1333 aa  399  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 1266 aa  396  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 		 1310 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 1625 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 		 1033 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  29.47 
 
 		 1683 aa  389  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 		 1267 aa  389  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  39.85 
 
 		 1417 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 		 1238 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 		 1426 aa  386  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 		 1238 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 		 1238 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 1284 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 		 1236 aa  386  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  38.66 
 
 		 1418 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 		 1238 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  36.47 
 
 		 1030 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 		 1234 aa  382  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  33.89 
 
 		 1200 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  35.07 
 
 		 1188 aa  379  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 		 1193 aa  380  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 1234 aa  378  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 1245 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 		 1611 aa  379  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 1230 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 1236 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  30.24 
 
 		 2035 aa  379  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  35.82 
 
 		 1574 aa  375  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 1691 aa  376  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 1236 aa  376  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 1236 aa  376  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 1245 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  39.41 
 
 		 1053 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 957 aa  373  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 1622 aa  374  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 1788 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 1303 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 920 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  40.66 
 
 		 923 aa  366  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 		 1659 aa  366  1e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.51 
 
 		 1629 aa  366  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 		 1166 aa  365  3e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.51 
 
 		 1629 aa  363  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.2 
 
 		 1643 aa  363  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  33.13 
 
 		 1236 aa  361  6e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2813  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.3 
 
 		 1632 aa  360  9.999999999999999e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 		 1009 aa  359  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 		 1333 aa  359  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 1363 aa  354  8e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 		 929 aa  352  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 916 aa  351  6e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.37 
 
 		 1233 aa  351  7e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.97 
 
 		 1303 aa  350  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 		 1202 aa  349  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  34.92 
 
 		 1214 aa  348  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.14 
 
 		 1069 aa  348  5e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3459  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  39.01 
 
 		 1055 aa  347  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 		 1021 aa  345  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3548  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 		 1681 aa  344  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 		 778 aa  344  8e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 1016 aa  344  9e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0482  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 		 1681 aa  343  9e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.37 
 
 		 812 aa  341  7e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 1240 aa  340  8e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 		 981 aa  340  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  35.52 
 
 		 1179 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1005 aa  337  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>