More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3028 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  45.61 
 
 
1418 aa  1158    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1426 aa  2912    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  40.08 
 
 
1626 aa  722    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 
1659 aa  713    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 
1629 aa  723    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2813  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 
1632 aa  648    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  45.66 
 
 
1417 aa  1150    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 
1629 aa  719    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.04 
 
 
1625 aa  741    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 
1374 aa  493  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 
1560 aa  476  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 
1245 aa  469  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.93 
 
 
2213 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 
1603 aa  440  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  38.44 
 
 
1353 aa  439  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
1765 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 
2654 aa  430  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 
1768 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 
1202 aa  423  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 
1767 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 
1767 aa  415  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 
1767 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  32.54 
 
 
1765 aa  413  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
1236 aa  410  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
1771 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  39.12 
 
 
1331 aa  410  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
1236 aa  410  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
1236 aa  410  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 
1788 aa  409  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  34.11 
 
 
1188 aa  407  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
1238 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 
1165 aa  406  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 
1266 aa  405  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  29.24 
 
 
1763 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 
1238 aa  403  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 
1238 aa  403  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 
1234 aa  403  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 
1230 aa  403  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 
1782 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 
1238 aa  403  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 
1786 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 
1582 aa  399  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 
1784 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
1611 aa  400  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 
920 aa  399  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 
1326 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
1267 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 
1622 aa  396  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 
1340 aa  396  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  33.22 
 
 
1200 aa  396  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
1236 aa  395  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  31.26 
 
 
1135 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.66 
 
 
1792 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 
1245 aa  389  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.89 
 
 
1158 aa  390  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  35.73 
 
 
2035 aa  388  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 
1245 aa  389  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 
1166 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  33.29 
 
 
1236 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 
916 aa  381  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  39.22 
 
 
1364 aa  382  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 
1033 aa  382  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
1234 aa  381  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3604  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 
1172 aa  382  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 
1128 aa  379  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 
1005 aa  375  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.28 
 
 
1548 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 
1009 aa  376  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  36.19 
 
 
1287 aa  372  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  37.72 
 
 
1683 aa  370  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4002  sensory transduction histidine kinase  35.49 
 
 
1689 aa  369  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  35.62 
 
 
1030 aa  369  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 
1303 aa  369  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  28.81 
 
 
1179 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 
957 aa  367  1e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.93 
 
 
1233 aa  366  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 
1284 aa  365  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 
816 aa  363  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 
1959 aa  362  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 
1303 aa  360  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 
981 aa  359  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 
1193 aa  358  5e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 
1310 aa  358  5.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 
1363 aa  356  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.8 
 
 
1468 aa  354  8e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 
1480 aa  353  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
929 aa  350  8e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.47 
 
 
1442 aa  350  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 
1021 aa  350  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 
1305 aa  349  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  31.3 
 
 
852 aa  348  4e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  35.34 
 
 
1439 aa  347  8e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 
1240 aa  347  8e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.86 
 
 
1053 aa  347  8e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 
1258 aa  347  8e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
833 aa  346  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  34.98 
 
 
1574 aa  344  5.999999999999999e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0482  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 
1681 aa  343  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.55 
 
 
1499 aa  343  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3548  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 
1681 aa  342  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>