More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1097 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1097  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
915 aa  1843    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  32.2 
 
 
917 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  31.82 
 
 
917 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.26 
 
 
918 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.37 
 
 
918 aa  333  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.37 
 
 
918 aa  333  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 
916 aa  333  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.37 
 
 
918 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.37 
 
 
918 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.48 
 
 
932 aa  330  9e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
917 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.54 
 
 
918 aa  328  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 
919 aa  326  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  27.56 
 
 
932 aa  325  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
917 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
917 aa  318  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.81 
 
 
906 aa  316  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  31.41 
 
 
925 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.2 
 
 
937 aa  313  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 
922 aa  312  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  31.3 
 
 
925 aa  312  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.9 
 
 
929 aa  306  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.82 
 
 
937 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.75 
 
 
950 aa  296  9e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  29.68 
 
 
905 aa  290  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.88 
 
 
941 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.91 
 
 
929 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  25.71 
 
 
926 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.87 
 
 
933 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.54 
 
 
921 aa  284  4.0000000000000003e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  26.05 
 
 
910 aa  283  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.15 
 
 
930 aa  278  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  25.87 
 
 
910 aa  278  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.2 
 
 
948 aa  272  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.7 
 
 
942 aa  270  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.05 
 
 
936 aa  265  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  27.98 
 
 
942 aa  261  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  31.08 
 
 
918 aa  253  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 
918 aa  253  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.08 
 
 
918 aa  253  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.08 
 
 
918 aa  253  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.08 
 
 
918 aa  253  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.08 
 
 
918 aa  253  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  31.08 
 
 
918 aa  253  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.08 
 
 
918 aa  253  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.08 
 
 
918 aa  253  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.44 
 
 
952 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1635  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.21 
 
 
930 aa  243  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.386153  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  29.41 
 
 
1042 aa  234  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  27.99 
 
 
1574 aa  233  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  28.23 
 
 
833 aa  231  6e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3291  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.62 
 
 
933 aa  230  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59315  hitchhiker  0.0011455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3146  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.42 
 
 
933 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.155765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1223  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.42 
 
 
933 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.915072  hitchhiker  0.00275603 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3344  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 
1390 aa  229  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.29 
 
 
922 aa  228  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1175  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.9 
 
 
935 aa  229  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.9 
 
 
935 aa  228  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.715392 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.83 
 
 
931 aa  227  7e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.99 
 
 
925 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.78 
 
 
928 aa  226  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3148  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.42 
 
 
932 aa  226  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0238696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.99 
 
 
950 aa  226  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3457  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.94 
 
 
935 aa  224  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.73 
 
 
927 aa  223  9e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1109  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.5 
 
 
935 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.527009 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2767  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.23 
 
 
933 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 
1131 aa  219  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 
1240 aa  218  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.49 
 
 
1245 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  28.19 
 
 
923 aa  216  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.66 
 
 
957 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 
956 aa  216  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 
914 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.96 
 
 
921 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0072  putative sensor/response hybrid  31.61 
 
 
527 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0111636 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.08 
 
 
918 aa  214  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.98 
 
 
1166 aa  213  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.06 
 
 
899 aa  212  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  30.34 
 
 
651 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.05 
 
 
1611 aa  211  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.74 
 
 
2213 aa  210  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 
633 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  28.14 
 
 
998 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.28 
 
 
1622 aa  209  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.74 
 
 
929 aa  209  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.68 
 
 
1768 aa  207  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  31.21 
 
 
934 aa  208  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.83 
 
 
1436 aa  207  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 
1426 aa  206  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  29.23 
 
 
778 aa  206  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  30.42 
 
 
785 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.84 
 
 
1498 aa  206  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.72 
 
 
1126 aa  205  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 
981 aa  204  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.45 
 
 
1284 aa  204  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  32.1 
 
 
651 aa  204  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 
801 aa  204  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  28.22 
 
 
1763 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 
705 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>