More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1555 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1172 aa  2402    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.31 
 
 		 1271 aa  776    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 		 1356 aa  371  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  34.63 
 
 		 1200 aa  359  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 1237 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 		 1917 aa  360  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  34.06 
 
 		 1137 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 		 1195 aa  357  5.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 		 1137 aa  357  7.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.29 
 
 		 1936 aa  354  5e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 		 2099 aa  350  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 1937 aa  350  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  33.62 
 
 		 1937 aa  349  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 2107 aa  348  4e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  32.63 
 
 		 1695 aa  346  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 		 2099 aa  346  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 		 1143 aa  344  4e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 		 1954 aa  344  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1142 aa  344  5.999999999999999e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  33.72 
 
 		 1196 aa  343  9e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 		 1038 aa  343  9e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 		 1839 aa  343  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 		 1155 aa  340  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 		 1168 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 		 1203 aa  338  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 		 1161 aa  337  5.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  32.23 
 
 		 1374 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  33.57 
 
 		 1161 aa  335  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  31.87 
 
 		 1278 aa  335  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 		 1937 aa  335  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 		 1155 aa  333  8e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.19 
 
 		 1201 aa  331  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 		 1163 aa  330  8e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 		 1362 aa  330  9e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 		 1896 aa  330  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 1141 aa  330  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 		 1155 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 		 1857 aa  328  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  31.97 
 
 		 1158 aa  327  1e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 		 1145 aa  326  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 		 1361 aa  324  5e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  31.26 
 
 		 1172 aa  322  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 1149 aa  320  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  33.75 
 
 		 1361 aa  318  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 		 1158 aa  318  4e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  31.25 
 
 		 1170 aa  318  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 		 1713 aa  317  7e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 		 1155 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 		 1216 aa  314  5.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 		 1680 aa  313  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 970 aa  313  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 		 917 aa  311  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 		 1158 aa  311  5.9999999999999995e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 		 1165 aa  310  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 		 1189 aa  305  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 1792 aa  303  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 		 1131 aa  301  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.92 
 
 		 1942 aa  301  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 2010 aa  301  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 		 858 aa  299  3e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 		 687 aa  294  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 		 2037 aa  294  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 		 1162 aa  292  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 974 aa  290  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1037 aa  288  5e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 977 aa  286  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 		 1022 aa  286  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 		 975 aa  285  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3332  sensor histidine kinase/response regulator  31.58 
 
 		 819 aa  283  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 		 791 aa  281  5e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 927 aa  281  7e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 		 969 aa  280  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 1046 aa  279  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.59 
 
 		 1363 aa  279  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 		 995 aa  278  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 		 1160 aa  277  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  31.25 
 
 		 998 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 		 1771 aa  275  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 		 1765 aa  275  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 		 1767 aa  275  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 1767 aa  274  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 1767 aa  274  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 		 1271 aa  274  9e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  31.54 
 
 		 1765 aa  273  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.27 
 
 		 1340 aa  273  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 		 823 aa  272  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 		 902 aa  270  8e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 		 755 aa  267  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 		 1768 aa  266  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 		 1177 aa  266  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 738 aa  266  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 1310 aa  265  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 796 aa  264  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 		 1003 aa  263  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 932 aa  262  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 1054 aa  262  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  30.68 
 
 		 910 aa  262  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 		 929 aa  262  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 		 916 aa  262  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  33.59 
 
 		 1346 aa  261  4e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>