More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0204 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
687 aa  1395    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.88 
 
 
755 aa  409  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.11 
 
 
977 aa  377  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.87 
 
 
974 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.7 
 
 
975 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  40.94 
 
 
970 aa  362  9e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.92 
 
 
991 aa  355  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  38.51 
 
 
1361 aa  351  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 
1362 aa  348  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  35.74 
 
 
1046 aa  347  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.91 
 
 
858 aa  345  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  39.68 
 
 
998 aa  343  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 
791 aa  341  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.92 
 
 
917 aa  341  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.76 
 
 
927 aa  333  5e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 
984 aa  333  5e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 
823 aa  333  5e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
798 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 
796 aa  326  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 
803 aa  326  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  36.93 
 
 
792 aa  325  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 
1271 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  36.74 
 
 
910 aa  317  5e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
1022 aa  313  4.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
1352 aa  310  6.999999999999999e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
1003 aa  304  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
1141 aa  298  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 
1172 aa  294  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 
1064 aa  289  9e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 
1038 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
1839 aa  287  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 
1158 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 
1356 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 
1195 aa  283  9e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 
1155 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 
1143 aa  281  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 
1857 aa  280  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 
1155 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 
1155 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
1896 aa  275  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 
1155 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  32.22 
 
 
1137 aa  272  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 
1137 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 
1168 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
1145 aa  270  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 
1163 aa  270  8e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
1917 aa  270  8.999999999999999e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  34.21 
 
 
1170 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
1149 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  31.31 
 
 
1200 aa  269  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 
1002 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  34.26 
 
 
1172 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 
1216 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
1165 aa  266  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 
2099 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0803  histidine kinase  36.23 
 
 
718 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0571523  hitchhiker  0.00843936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 
933 aa  265  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 
1201 aa  264  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 
2099 aa  263  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
1310 aa  262  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  30.76 
 
 
1278 aa  262  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  32.48 
 
 
1695 aa  262  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 
1363 aa  261  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  31.17 
 
 
1158 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 
1158 aa  259  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.15 
 
 
1274 aa  257  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
1680 aa  257  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 
1954 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 
1713 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  35.51 
 
 
1629 aa  254  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  32.83 
 
 
1161 aa  254  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 
1037 aa  254  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 
1936 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  35.6 
 
 
1526 aa  254  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 
1159 aa  253  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 
1937 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  30.5 
 
 
1374 aa  253  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  32.82 
 
 
1937 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  34.4 
 
 
1135 aa  251  3e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 
1161 aa  251  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 
1194 aa  250  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.67 
 
 
1442 aa  249  9e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
1142 aa  249  9e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 
780 aa  249  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 
1267 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.43 
 
 
1203 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  34.27 
 
 
1130 aa  247  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  33.11 
 
 
1127 aa  247  4.9999999999999997e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  37.77 
 
 
603 aa  246  9e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 
2107 aa  246  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1834  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.36 
 
 
569 aa  246  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 
929 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  33.88 
 
 
1322 aa  245  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 
1237 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5390  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 
1195 aa  245  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596605  hitchhiker  0.00757911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 
2037 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3328  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 
1482 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.55 
 
 
1326 aa  244  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  35.03 
 
 
923 aa  244  5e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 
1230 aa  243  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>