More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0213 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 974 aa  1952    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  82.17 
 
 		 975 aa  1552    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  44.29 
 
 		 970 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.58 
 
 		 858 aa  405  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.95 
 
 		 977 aa  403  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.96 
 
 		 796 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.05 
 
 		 917 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.06 
 
 		 687 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.99 
 
 		 791 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  40.04 
 
 		 998 aa  363  9e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.75 
 
 		 991 aa  360  8e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 1022 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.68 
 
 		 798 aa  355  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  39.93 
 
 		 1361 aa  352  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  38.94 
 
 		 910 aa  352  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  43.29 
 
 		 792 aa  350  7e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.29 
 
 		 803 aa  350  9e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.52 
 
 		 1362 aa  347  8.999999999999999e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 823 aa  344  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.7 
 
 		 927 aa  334  6e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  36 
 
 		 1046 aa  326  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.56 
 
 		 984 aa  325  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 		 1003 aa  324  6e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 		 755 aa  323  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 1143 aa  312  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 1271 aa  312  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  37 
 
 		 1145 aa  304  5.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 1158 aa  300  7e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 		 1165 aa  299  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 1356 aa  298  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 		 1195 aa  298  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 1917 aa  293  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.69 
 
 		 1937 aa  292  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  38.69 
 
 		 1937 aa  291  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 1155 aa  291  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 1172 aa  291  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 		 1203 aa  289  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 		 1149 aa  289  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 		 1155 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 		 989 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  35.9 
 
 		 1695 aa  287  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 989 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 		 2107 aa  286  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 1155 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 1954 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 1141 aa  285  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 		 1090 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 1163 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.73 
 
 		 1936 aa  283  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 		 1168 aa  282  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 2099 aa  281  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 1155 aa  280  6e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 1896 aa  280  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  32.92 
 
 		 1158 aa  280  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1201 aa  278  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 		 1782 aa  278  5e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 1038 aa  277  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 		 1937 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  34.36 
 
 		 1137 aa  275  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 1680 aa  275  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 		 1398 aa  275  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.17 
 
 		 1194 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 		 1407 aa  274  6e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 		 1839 aa  274  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 		 1137 aa  273  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 		 2099 aa  273  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  32.9 
 
 		 1196 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 		 1135 aa  271  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 		 1713 aa  271  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.77 
 
 		 2213 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 1064 aa  270  8e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.28 
 
 		 1267 aa  270  8.999999999999999e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  33.04 
 
 		 1278 aa  268  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 		 957 aa  268  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 		 1002 aa  268  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 		 1142 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  33.8 
 
 		 1161 aa  266  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  38.68 
 
 		 1392 aa  265  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 		 1352 aa  265  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  34.3 
 
 		 1170 aa  265  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 		 1177 aa  264  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  33.81 
 
 		 1172 aa  263  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 		 1397 aa  263  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 1326 aa  262  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  32.47 
 
 		 1200 aa  261  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 		 1161 aa  260  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 		 1159 aa  260  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 		 1189 aa  258  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.426502  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 		 1284 aa  258  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.94 
 
 		 1820 aa  257  8e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  32.63 
 
 		 1560 aa  257  9e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.6 
 
 		 1068 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 		 1964 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 		 1548 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 		 770 aa  254  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 		 833 aa  254  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0325  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 		 2037 aa  251  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 		 1853 aa  251  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 1791 aa  251  7e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 		 1942 aa  250  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>